23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3076 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3733  hypothetical protein  92.04 
 
 		 578 aa  1087    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0950  hypothetical protein  81.14 
 
 		 578 aa  964    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3076  hypothetical protein  100 
 
 		 578 aa  1182    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.647061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0896  hypothetical protein  98.44 
 
 		 578 aa  1166    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3190  hypothetical protein  52.69 
 
 		 574 aa  645    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0859  hypothetical protein  96.37 
 
 		 578 aa  1122    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0958  hypothetical protein  81.49 
 
 		 578 aa  968    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0924  hypothetical protein  81.66 
 
 		 578 aa  968    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3412  hypothetical protein  81.66 
 
 		 578 aa  969    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0779  hypothetical protein  55.65 
 
 		 576 aa  649    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0748977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3060  hypothetical protein  81.66 
 
 		 578 aa  972    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.139923  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3804  hypothetical protein  53.97 
 
 		 582 aa  633  1e-180  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0656  hypothetical protein  52.78 
 
 		 574 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0668  hypothetical protein  50.44 
 
 		 571 aa  590  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  unclonable  0.00000473139 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2895  hypothetical protein  49.39 
 
 		 569 aa  567  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0937  hypothetical protein  46.35 
 
 		 572 aa  554  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000154044  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2792  hypothetical protein  44.43 
 
 		 575 aa  483  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001077  hypothetical protein  31.65 
 
 		 584 aa  299  9e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00935089  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04809  hypothetical protein  34.64 
 
 		 597 aa  292  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3607  pilus retraction protein PilT  29.79 
 
 		 700 aa  218  2.9999999999999998e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.13786  decreased coverage  0.000230198 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0857  hypothetical protein  28.41 
 
 		 699 aa  201  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.866373 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0837  hypothetical protein  22.5 
 
 		 568 aa  99  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2391  hypothetical protein  26.08 
 
 		 562 aa  81.3  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.71929  normal  0.65601 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>