23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0924 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3733  hypothetical protein  80.62 
 
 
578 aa  965    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0958  hypothetical protein  99.83 
 
 
578 aa  1179    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0924  hypothetical protein  100 
 
 
578 aa  1179    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0779  hypothetical protein  53.91 
 
 
576 aa  637    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0748977  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3060  hypothetical protein  87.54 
 
 
578 aa  1039    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.139923  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3412  hypothetical protein  99.83 
 
 
578 aa  1177    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0859  hypothetical protein  82.35 
 
 
578 aa  975    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3190  hypothetical protein  55.11 
 
 
574 aa  668    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0896  hypothetical protein  82.18 
 
 
578 aa  961    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3076  hypothetical protein  81.66 
 
 
578 aa  968    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.647061  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0950  hypothetical protein  99.31 
 
 
578 aa  1173    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3804  hypothetical protein  52.07 
 
 
582 aa  620  1e-176  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0656  hypothetical protein  52.08 
 
 
574 aa  610  1e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0668  hypothetical protein  50.44 
 
 
571 aa  598  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  unclonable  0.00000473139 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2895  hypothetical protein  50.18 
 
 
569 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127239  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0937  hypothetical protein  46.53 
 
 
572 aa  566  1e-160  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000154044  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2792  hypothetical protein  45.01 
 
 
575 aa  491  1e-137  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04809  hypothetical protein  35.89 
 
 
597 aa  306  7e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001077  hypothetical protein  32.01 
 
 
584 aa  295  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00935089  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3607  pilus retraction protein PilT  30.56 
 
 
700 aa  221  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.13786  decreased coverage  0.000230198 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0857  hypothetical protein  27.79 
 
 
699 aa  195  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.866373 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0837  hypothetical protein  22.44 
 
 
568 aa  87.4  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2391  hypothetical protein  24.26 
 
 
562 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.71929  normal  0.65601 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>