22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04809 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001077  hypothetical protein  65.3 
 
 
584 aa  775    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00935089  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04809  hypothetical protein  100 
 
 
597 aa  1217    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0779  hypothetical protein  36.3 
 
 
576 aa  323  6e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0748977  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3804  hypothetical protein  34.67 
 
 
582 aa  318  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3412  hypothetical protein  36.07 
 
 
578 aa  309  9e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0950  hypothetical protein  36.07 
 
 
578 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3060  hypothetical protein  35.77 
 
 
578 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.139923  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0958  hypothetical protein  35.89 
 
 
578 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0668  hypothetical protein  35.42 
 
 
571 aa  307  5.0000000000000004e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  unclonable  0.00000473139 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0924  hypothetical protein  35.89 
 
 
578 aa  306  6e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3190  hypothetical protein  33.45 
 
 
574 aa  302  1e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0937  hypothetical protein  34.81 
 
 
572 aa  299  1e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000154044  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0859  hypothetical protein  35 
 
 
578 aa  296  7e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3733  hypothetical protein  34.6 
 
 
578 aa  294  3e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3076  hypothetical protein  34.66 
 
 
578 aa  294  4e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.647061  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0896  hypothetical protein  35.28 
 
 
578 aa  291  2e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2792  hypothetical protein  32.48 
 
 
575 aa  278  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0656  hypothetical protein  31.36 
 
 
574 aa  261  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2895  hypothetical protein  31.36 
 
 
569 aa  249  9e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127239  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0857  hypothetical protein  27.17 
 
 
699 aa  138  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.866373 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3607  pilus retraction protein PilT  26.78 
 
 
700 aa  131  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.13786  decreased coverage  0.000230198 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2391  hypothetical protein  29.91 
 
 
562 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.71929  normal  0.65601 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>