23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0950 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3733  hypothetical protein  80.1 
 
 
578 aa  962    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0958  hypothetical protein  99.13 
 
 
578 aa  1174    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0924  hypothetical protein  99.31 
 
 
578 aa  1173    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0779  hypothetical protein  54.26 
 
 
576 aa  640    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0748977  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3060  hypothetical protein  87.2 
 
 
578 aa  1037    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.139923  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3412  hypothetical protein  99.13 
 
 
578 aa  1172    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0859  hypothetical protein  81.83 
 
 
578 aa  971    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3190  hypothetical protein  55.46 
 
 
574 aa  671    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0896  hypothetical protein  81.66 
 
 
578 aa  956    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3076  hypothetical protein  81.14 
 
 
578 aa  965    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.647061  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0950  hypothetical protein  100 
 
 
578 aa  1179    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3804  hypothetical protein  52.07 
 
 
582 aa  622  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0656  hypothetical protein  52.43 
 
 
574 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0668  hypothetical protein  50.61 
 
 
571 aa  600  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  unclonable  0.00000473139 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2895  hypothetical protein  50.18 
 
 
569 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127239  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0937  hypothetical protein  46.7 
 
 
572 aa  568  1e-161  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000154044  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2792  hypothetical protein  44.79 
 
 
575 aa  492  9.999999999999999e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04809  hypothetical protein  36.07 
 
 
597 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001077  hypothetical protein  31.65 
 
 
584 aa  294  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00935089  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3607  pilus retraction protein PilT  30.38 
 
 
700 aa  218  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.13786  decreased coverage  0.000230198 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0857  hypothetical protein  27.97 
 
 
699 aa  194  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.866373 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0837  hypothetical protein  21.59 
 
 
568 aa  87.4  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2391  hypothetical protein  24.06 
 
 
562 aa  70.1  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.71929  normal  0.65601 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>