22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0837 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0837  hypothetical protein  100 
 
 
568 aa  1129    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2391  hypothetical protein  26.08 
 
 
562 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.71929  normal  0.65601 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0937  hypothetical protein  23.83 
 
 
572 aa  102  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000154044  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3076  hypothetical protein  22.69 
 
 
578 aa  97.8  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.647061  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0896  hypothetical protein  22.72 
 
 
578 aa  96.3  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0859  hypothetical protein  22.91 
 
 
578 aa  96.3  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3733  hypothetical protein  22.11 
 
 
578 aa  95.9  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0779  hypothetical protein  24.08 
 
 
576 aa  93.2  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0748977  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0668  hypothetical protein  21.34 
 
 
571 aa  91.3  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  unclonable  0.00000473139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3190  hypothetical protein  20.36 
 
 
574 aa  89  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0656  hypothetical protein  22.86 
 
 
574 aa  87.4  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3412  hypothetical protein  22.54 
 
 
578 aa  87  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0950  hypothetical protein  21.64 
 
 
578 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0924  hypothetical protein  22.54 
 
 
578 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0958  hypothetical protein  22.54 
 
 
578 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3060  hypothetical protein  23.01 
 
 
578 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.139923  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0857  hypothetical protein  23.61 
 
 
699 aa  76.6  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.866373 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3804  hypothetical protein  21.6 
 
 
582 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2792  hypothetical protein  21.89 
 
 
575 aa  73.6  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3607  pilus retraction protein PilT  23.75 
 
 
700 aa  71.2  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.13786  decreased coverage  0.000230198 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2895  hypothetical protein  21.11 
 
 
569 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127239  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001077  hypothetical protein  25.17 
 
 
584 aa  60.5  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00935089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>