23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0896 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3733  hypothetical protein  91.7 
 
 		 578 aa  1084    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0950  hypothetical protein  81.66 
 
 		 578 aa  967    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3076  hypothetical protein  98.44 
 
 		 578 aa  1166    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.647061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0896  hypothetical protein  100 
 
 		 578 aa  1183    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3190  hypothetical protein  52.51 
 
 		 574 aa  640    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0859  hypothetical protein  96.89 
 
 		 578 aa  1126    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0958  hypothetical protein  82.01 
 
 		 578 aa  971    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0924  hypothetical protein  82.18 
 
 		 578 aa  971    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3412  hypothetical protein  82.18 
 
 		 578 aa  972    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0779  hypothetical protein  55.65 
 
 		 576 aa  650    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0748977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3060  hypothetical protein  81.66 
 
 		 578 aa  971    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.139923  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3804  hypothetical protein  53.97 
 
 		 582 aa  632  1e-180  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0656  hypothetical protein  52.6 
 
 		 574 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0668  hypothetical protein  50.26 
 
 		 571 aa  592  1e-168  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  unclonable  0.00000473139 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2895  hypothetical protein  49.74 
 
 		 569 aa  568  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0937  hypothetical protein  45.83 
 
 		 572 aa  546  1e-154  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000154044  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2792  hypothetical protein  44.77 
 
 		 575 aa  484  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001077  hypothetical protein  32.61 
 
 		 584 aa  301  3e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00935089  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04809  hypothetical protein  34.99 
 
 		 597 aa  294  3e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3607  pilus retraction protein PilT  30.31 
 
 		 700 aa  224  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.13786  decreased coverage  0.000230198 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0857  hypothetical protein  28.6 
 
 		 699 aa  201  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.866373 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0837  hypothetical protein  22.71 
 
 		 568 aa  99.4  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2391  hypothetical protein  25.86 
 
 		 562 aa  86.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.71929  normal  0.65601 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>