40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8586 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8586  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  482  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3136  type 12 methyltransferase  61.64 
 
 
231 aa  271  7e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.435875  normal  0.0936944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1022  Methyltransferase type 12  46.61 
 
 
242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  34.55 
 
 
283 aa  53.5  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  35.78 
 
 
270 aa  50.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2575  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 
264 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 
268 aa  47.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.11 
 
 
235 aa  47  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  41.82 
 
 
511 aa  46.2  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0666  hypothetical protein  21.34 
 
 
233 aa  45.8  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  33.93 
 
 
253 aa  45.4  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  31.19 
 
 
268 aa  45.4  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  31.19 
 
 
254 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  30.63 
 
 
267 aa  44.7  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  25.95 
 
 
255 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 
225 aa  44.7  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  30.91 
 
 
267 aa  45.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1497  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.43 
 
 
212 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0964  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.56 
 
 
217 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.417338  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.93 
 
 
296 aa  43.9  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5566  methyltransferase type 12  45.83 
 
 
267 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.509991  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2836  methyltransferase type 11  24.31 
 
 
234 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.167679 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.92 
 
 
200 aa  43.9  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0754126  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  31.19 
 
 
273 aa  43.5  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.81 
 
 
229 aa  43.5  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  38.18 
 
 
281 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  30.39 
 
 
252 aa  43.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5480  methyltransferase type 12  33.68 
 
 
245 aa  43.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3316  methyltransferase type 12  36 
 
 
174 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712949  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 
317 aa  42.7  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5212  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.78 
 
 
200 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0540942  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1621  trans-aconitate methyltransferase  35.44 
 
 
344 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898496  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  38.18 
 
 
198 aa  42.7  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  32.5 
 
 
295 aa  42.4  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6211  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  30.28 
 
 
225 aa  42.4  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1882  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  30.19 
 
 
211 aa  42.4  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  30.89 
 
 
276 aa  42.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3961  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.13 
 
 
212 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  32.53 
 
 
295 aa  42  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  27.78 
 
 
228 aa  42  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>