44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3136 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3136  type 12 methyltransferase  100 
 
 		 231 aa  461  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.435875  normal  0.0936944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8586  hypothetical protein  61.64 
 
 		 244 aa  271  9e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1022  Methyltransferase type 12  49.36 
 
 		 242 aa  190  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 270 aa  54.3  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.74 
 
 		 258 aa  53.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 268 aa  52.4  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  28.95 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2836  methyltransferase type 11  27.08 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.167679 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 283 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  28.71 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3316  methyltransferase type 12  30.1 
 
 		 174 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  23.72 
 
 		 283 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  35.79 
 
 		 291 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  23.72 
 
 		 283 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.05 
 
 		 258 aa  45.8  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.69 
 
 		 258 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5212  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.38 
 
 		 200 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0540942  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4809  Methyltransferase type 11  26.52 
 
 		 229 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 		 254 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.3 
 
 		 200 aa  45.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0754126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.01 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3961  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.69 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0604  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.77 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.977459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.21 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2575  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 		 264 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.65 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  33.03 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4115  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  29.81 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1882  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  32.69 
 
 		 211 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 198 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0972  hypothetical protein  25.24 
 
 		 177 aa  43.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1554  hypothetical protein  26.23 
 
 		 315 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000923024  normal  0.0128521 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  35 
 
 		 258 aa  42.4  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1497  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.77 
 
 		 212 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 268 aa  42.4  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 239 aa  42  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0823  methyltransferase type 12  29.13 
 
 		 183 aa  42  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0810  methyltransferase type 12  28.16 
 
 		 174 aa  41.6  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743802 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  27.72 
 
 		 246 aa  41.6  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.78 
 
 		 262 aa  41.6  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.93 
 
 		 296 aa  41.6  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2685  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  27.27 
 
 		 229 aa  41.6  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  29.66 
 
 		 295 aa  41.6  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>