27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7893 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7893  hypothetical protein  100 
 
 
634 aa  1259    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0072  hypothetical protein  43.8 
 
 
629 aa  518  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2444  hypothetical protein  44.68 
 
 
620 aa  483  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.132408 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0496  TrkA-N domain protein  43.23 
 
 
623 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8791  hypothetical protein  42.16 
 
 
621 aa  456  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1461  TrkA domain-containing protein  40.65 
 
 
653 aa  398  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26360  K+ transport system, NAD-binding component  31.64 
 
 
497 aa  222  9.999999999999999e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.427591  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3469  hypothetical protein  27.53 
 
 
652 aa  163  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94483  predicted protein  25.13 
 
 
571 aa  151  3e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.13386 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0073  hypothetical protein  19.15 
 
 
586 aa  89.4  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  27.88 
 
 
332 aa  61.2  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  27.88 
 
 
332 aa  60.5  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2916  TrkA-N domain protein  27.35 
 
 
477 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.380494  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2854  TrkA-N domain protein  22.7 
 
 
331 aa  52  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0453  Ion transport 2 domain protein  28.03 
 
 
347 aa  49.7  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  24.63 
 
 
344 aa  48.9  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5008  hypothetical protein  19.05 
 
 
331 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4718  Ion transport 2 domain-containing protein  19.2 
 
 
331 aa  46.6  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0856432  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5128  hypothetical protein  19.05 
 
 
331 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4627  potassium channel protein  19.05 
 
 
331 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4605  potassium channel protein  19.05 
 
 
331 aa  46.2  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4765  hypothetical protein  19.05 
 
 
331 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.641012  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  28.18 
 
 
395 aa  44.7  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01339  Kef-type K+ transport system, predicted NAD-binding component  23.2 
 
 
351 aa  44.3  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5035  hypothetical protein  20 
 
 
331 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0193988  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1223  Ion transport 2  23.97 
 
 
349 aa  44.7  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5028  hypothetical protein  19.03 
 
 
331 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>