14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1461 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1461  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 653 aa  1295    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0072  hypothetical protein  44.27 
 
 		 629 aa  512  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2444  hypothetical protein  45.06 
 
 		 620 aa  476  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.132408 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0496  TrkA-N domain protein  44.43 
 
 		 623 aa  464  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8791  hypothetical protein  43.86 
 
 		 621 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7893  hypothetical protein  40.81 
 
 		 634 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26360  K+ transport system, NAD-binding component  34.71 
 
 		 497 aa  219  1e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.427591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94483  predicted protein  26.27 
 
 		 571 aa  155  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.13386 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3469  hypothetical protein  25.6 
 
 		 652 aa  123  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0073  hypothetical protein  22.3 
 
 		 586 aa  96.7  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  25.36 
 
 		 542 aa  47.4  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1810  Ion transport 2 domain protein  27.91 
 
 		 345 aa  47  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.236415  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5275  Ion transport 2 domain protein  22.51 
 
 		 344 aa  45.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3000  Ion transport 2 domain protein  24.6 
 
 		 331 aa  45.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>