18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2444 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2444  hypothetical protein  100 
 
 
620 aa  1249    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.132408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8791  hypothetical protein  70.48 
 
 
621 aa  905    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0496  TrkA-N domain protein  56.43 
 
 
623 aa  685    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0072  hypothetical protein  49.92 
 
 
629 aa  627  1e-178  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1461  TrkA domain-containing protein  45.06 
 
 
653 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7893  hypothetical protein  44.68 
 
 
634 aa  450  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26360  K+ transport system, NAD-binding component  34.37 
 
 
497 aa  273  7e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.427591  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94483  predicted protein  25.59 
 
 
571 aa  188  3e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.13386 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3469  hypothetical protein  27.69 
 
 
652 aa  182  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0073  hypothetical protein  20.35 
 
 
586 aa  92.4  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2854  TrkA-N domain protein  21.97 
 
 
331 aa  53.9  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  22.75 
 
 
346 aa  47  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  25.33 
 
 
332 aa  45.8  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01339  Kef-type K+ transport system, predicted NAD-binding component  21.48 
 
 
351 aa  45.4  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  20.69 
 
 
351 aa  45.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  20.69 
 
 
351 aa  45.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  20.69 
 
 
351 aa  44.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  25.85 
 
 
366 aa  44.3  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>