15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0496 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0496  TrkA-N domain protein  100 
 
 
623 aa  1253    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8791  hypothetical protein  53.54 
 
 
621 aa  652    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2444  hypothetical protein  56.43 
 
 
620 aa  685    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.132408 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0072  hypothetical protein  51.82 
 
 
629 aa  621  1e-176  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1461  TrkA domain-containing protein  44.43 
 
 
653 aa  458  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7893  hypothetical protein  43.23 
 
 
634 aa  435  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26360  K+ transport system, NAD-binding component  31.12 
 
 
497 aa  228  2e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.427591  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3469  hypothetical protein  27 
 
 
652 aa  157  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94483  predicted protein  25.5 
 
 
571 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.13386 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0073  hypothetical protein  21.98 
 
 
586 aa  123  9e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2854  TrkA-N domain protein  21.45 
 
 
331 aa  48.5  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2916  TrkA-N domain protein  23.51 
 
 
477 aa  47.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.380494  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  31.14 
 
 
332 aa  47  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3507  Ion transport 2 domain-containing protein  21.24 
 
 
331 aa  45.8  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00681097  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  30.54 
 
 
332 aa  43.9  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>