14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3469 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3469  hypothetical protein  100 
 
 
652 aa  1309    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0072  hypothetical protein  28.18 
 
 
629 aa  211  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2444  hypothetical protein  27.69 
 
 
620 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.132408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8791  hypothetical protein  26.38 
 
 
621 aa  168  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0496  TrkA-N domain protein  27 
 
 
623 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7893  hypothetical protein  28.23 
 
 
634 aa  150  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1461  TrkA domain-containing protein  26.25 
 
 
653 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26360  K+ transport system, NAD-binding component  27.55 
 
 
497 aa  119  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.427591  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0073  hypothetical protein  18.26 
 
 
586 aa  62.4  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94483  predicted protein  21.26 
 
 
571 aa  60.1  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.13386 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2916  TrkA-N domain protein  25.25 
 
 
477 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.380494  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2854  TrkA-N domain protein  24.16 
 
 
331 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1810  Ion transport 2 domain protein  24.26 
 
 
345 aa  46.6  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.236415  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3507  Ion transport 2 domain-containing protein  19.86 
 
 
331 aa  44.3  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00681097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>