23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0025 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0025  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0014866  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33040  hypothetical protein  64.09 
 
 		 181 aa  220  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0783  hypothetical protein  74.83 
 
 		 170 aa  216  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4734  hypothetical protein  66.23 
 
 		 152 aa  197  7.999999999999999e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4590  hypothetical protein  64.83 
 
 		 191 aa  187  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3047  hypothetical protein  60.81 
 
 		 159 aa  176  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0682025  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1521  hypothetical protein  56.58 
 
 		 217 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427977  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1550  hypothetical protein  57.55 
 
 		 199 aa  147  9e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1573  hypothetical protein  57.55 
 
 		 199 aa  147  9e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2715  hypothetical protein  31.05 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.51319  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0051  hypothetical protein  27.4 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0049  hypothetical protein  27.4 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6368  integral membrane protein  29.3 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0072  multicopper oxidase domain-containing protein  25.68 
 
 		 630 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.14066 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  27.4 
 
 		 640 aa  52.4  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2559  hypothetical protein  28.99 
 
 		 264 aa  52  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.777014  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0105  integral membrane protein  30.56 
 
 		 249 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.74446 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2590  multicopper oxidase, type 3  21.92 
 
 		 526 aa  48.5  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.238338  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10816  hypothetical protein  25.82 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1040  multicopper oxidase type 3  23.08 
 
 		 609 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172495  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2540  putative integral membrane protein  29.17 
 
 		 249 aa  43.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3940  hypothetical protein  29.93 
 
 		 160 aa  42  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.393279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  58.06 
 
 		 362 aa  41.6  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>