19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1550 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1550  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1573  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1521  hypothetical protein  92.75 
 
 		 217 aa  327  7e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427977  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0025  hypothetical protein  57.55 
 
 		 202 aa  157  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0014866  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4590  hypothetical protein  56.43 
 
 		 191 aa  157  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3047  hypothetical protein  59.54 
 
 		 159 aa  153  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0682025  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4734  hypothetical protein  56.12 
 
 		 152 aa  152  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33040  hypothetical protein  55.71 
 
 		 181 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0783  hypothetical protein  52.52 
 
 		 170 aa  142  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0105  integral membrane protein  32.64 
 
 		 249 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.74446 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2715  hypothetical protein  35.66 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.51319  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2540  putative integral membrane protein  32.64 
 
 		 249 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6972  integral membrane protein  29.41 
 
 		 237 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6368  integral membrane protein  30.22 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10816  hypothetical protein  30.23 
 
 		 227 aa  45.8  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3940  hypothetical protein  32.52 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.393279  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0051  hypothetical protein  26.67 
 
 		 288 aa  43.1  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0049  hypothetical protein  26.67 
 
 		 288 aa  42.4  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2590  multicopper oxidase, type 3  27.22 
 
 		 526 aa  42  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.238338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>