14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6972 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6972  integral membrane protein  100 
 
 		 237 aa  475  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2540  putative integral membrane protein  56.56 
 
 		 249 aa  263  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0105  integral membrane protein  54.96 
 
 		 249 aa  246  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.74446 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6368  integral membrane protein  36.82 
 
 		 221 aa  142  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2715  hypothetical protein  35.68 
 
 		 235 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.51319  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1586  hypothetical protein  56.9 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.540023  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2559  hypothetical protein  28.82 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.777014  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2590  multicopper oxidase, type 3  24.57 
 
 		 526 aa  49.3  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.238338  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1040  multicopper oxidase type 3  27.85 
 
 		 609 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172495  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0783  hypothetical protein  28.48 
 
 		 170 aa  45.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33040  hypothetical protein  26.45 
 
 		 181 aa  43.5  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1521  hypothetical protein  27.61 
 
 		 217 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427977  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1550  hypothetical protein  29.41 
 
 		 199 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1573  hypothetical protein  29.41 
 
 		 199 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>