22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6368 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6368  integral membrane protein  100 
 
 		 221 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2540  putative integral membrane protein  38.33 
 
 		 249 aa  159  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2715  hypothetical protein  38.63 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.51319  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0105  integral membrane protein  39.91 
 
 		 249 aa  142  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.74446 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6972  integral membrane protein  36.82 
 
 		 237 aa  142  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2559  hypothetical protein  28.96 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.777014  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0051  hypothetical protein  27.56 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1040  multicopper oxidase type 3  27.07 
 
 		 609 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172495  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2590  multicopper oxidase, type 3  26.32 
 
 		 526 aa  62  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.238338  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0049  hypothetical protein  27.43 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0072  multicopper oxidase domain-containing protein  27.13 
 
 		 630 aa  58.5  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.14066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0025  hypothetical protein  29.3 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0014866  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3047  hypothetical protein  31.51 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0682025  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0783  hypothetical protein  31.88 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  24.86 
 
 		 640 aa  55.1  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33040  hypothetical protein  29.53 
 
 		 181 aa  52  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1586  hypothetical protein  42.11 
 
 		 116 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.540023  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4734  hypothetical protein  25.17 
 
 		 152 aa  43.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4590  hypothetical protein  29.37 
 
 		 191 aa  42.4  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1521  hypothetical protein  29.2 
 
 		 217 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427977  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1573  hypothetical protein  29.2 
 
 		 199 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1550  hypothetical protein  29.2 
 
 		 199 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>