20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4734 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4734  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  290  4e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0025  hypothetical protein  66.23 
 
 
202 aa  198  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0014866  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33040  hypothetical protein  68.39 
 
 
181 aa  197  6e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4590  hypothetical protein  72.54 
 
 
191 aa  195  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6541  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0783  hypothetical protein  66.2 
 
 
170 aa  181  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3047  hypothetical protein  58.39 
 
 
159 aa  163  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0682025  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1521  hypothetical protein  55.63 
 
 
217 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427977  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1550  hypothetical protein  56.12 
 
 
199 aa  144  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1573  hypothetical protein  56.12 
 
 
199 aa  144  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2715  hypothetical protein  32.69 
 
 
235 aa  53.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.51319  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0049  hypothetical protein  23.94 
 
 
288 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2559  hypothetical protein  32.86 
 
 
264 aa  50.8  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.777014  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0051  hypothetical protein  23.24 
 
 
288 aa  50.4  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10816  hypothetical protein  28.68 
 
 
227 aa  47.4  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  27.27 
 
 
640 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0072  multicopper oxidase domain-containing protein  25.69 
 
 
630 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.14066 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3940  hypothetical protein  33.58 
 
 
160 aa  44.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.393279  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6368  integral membrane protein  25.17 
 
 
221 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0105  integral membrane protein  27.08 
 
 
249 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.74446 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2590  multicopper oxidase, type 3  25 
 
 
526 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.238338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>