17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0105 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0105  integral membrane protein  100 
 
 		 249 aa  498  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.74446 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2540  putative integral membrane protein  86.35 
 
 		 249 aa  441  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6972  integral membrane protein  54.96 
 
 		 237 aa  256  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6368  integral membrane protein  38.08 
 
 		 221 aa  145  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2715  hypothetical protein  38.49 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.51319  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1586  hypothetical protein  75.86 
 
 		 116 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.540023  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33040  hypothetical protein  30.56 
 
 		 181 aa  52.8  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0783  hypothetical protein  28.47 
 
 		 170 aa  52.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0025  hypothetical protein  30.56 
 
 		 202 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0014866  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1573  hypothetical protein  32.64 
 
 		 199 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1550  hypothetical protein  32.64 
 
 		 199 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2559  hypothetical protein  28.7 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.777014  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1521  hypothetical protein  31.25 
 
 		 217 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427977  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0049  hypothetical protein  32.38 
 
 		 288 aa  42.7  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4734  hypothetical protein  27.08 
 
 		 152 aa  42.7  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0051  hypothetical protein  31.43 
 
 		 288 aa  42  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4590  hypothetical protein  27.56 
 
 		 191 aa  42  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6541  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>