24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1960 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1960  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  315  1e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.616556  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2200  hypothetical protein  63.76 
 
 		 150 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0036966  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4486  hypothetical protein  63.09 
 
 		 161 aa  208  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2213  hypothetical protein  63.09 
 
 		 150 aa  207  4e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00174935  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2171  hypothetical protein  61.74 
 
 		 161 aa  205  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00980217  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2221  hypothetical protein  61.07 
 
 		 161 aa  203  6e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000880424  normal  0.25123 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2106  hypothetical protein  55.41 
 
 		 161 aa  192  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121868  normal  0.452338 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2365  hypothetical protein  55.41 
 
 		 161 aa  187  5e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2005  hypothetical protein  54.73 
 
 		 161 aa  187  5e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00021351  hitchhiker  0.000000141582 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1970  hypothetical protein  54.73 
 
 		 161 aa  187  5e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000508823  hitchhiker  0.00854934 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2210  hypothetical protein  48.09 
 
 		 141 aa  146  8e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.120945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2426  hypothetical protein  44.3 
 
 		 154 aa  144  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0117545  hitchhiker  0.0000688315 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1852  hypothetical protein  53.91 
 
 		 172 aa  138  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000309219  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2213  hypothetical protein  42.96 
 
 		 165 aa  137  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000117467  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2009  hypothetical protein  43.33 
 
 		 150 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000579412  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1984  hypothetical protein  46.9 
 
 		 165 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000029351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1790  hypothetical protein  43.97 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0036932  normal  0.183021 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1997  putative lipoprotein  31.21 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.481992  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0988  hypothetical protein  23.65 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0940  hypothetical protein  31.25 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0904  hypothetical protein  22.97 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000194814  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0918  hypothetical protein  22.97 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000461903  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0369  hypothetical protein  26.5 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1137  hypothetical protein  24.77 
 
 		 148 aa  40.4  0.008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>