28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2106 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2106  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  337  4e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121868  normal  0.452338 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2005  hypothetical protein  80.75 
 
 		 161 aa  284  4e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00021351  hitchhiker  0.000000141582 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1970  hypothetical protein  80.75 
 
 		 161 aa  284  4e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000508823  hitchhiker  0.00854934 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2365  hypothetical protein  72.67 
 
 		 161 aa  254  4e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2221  hypothetical protein  63.52 
 
 		 161 aa  220  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000880424  normal  0.25123 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2171  hypothetical protein  63.52 
 
 		 161 aa  219  9e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00980217  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4486  hypothetical protein  61.64 
 
 		 161 aa  217  6e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2200  hypothetical protein  60.14 
 
 		 150 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0036966  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2213  hypothetical protein  61.43 
 
 		 150 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00174935  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1960  hypothetical protein  55.41 
 
 		 151 aa  192  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.616556  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2210  hypothetical protein  53.08 
 
 		 141 aa  166  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.120945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2426  hypothetical protein  47.45 
 
 		 154 aa  154  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0117545  hitchhiker  0.0000688315 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2009  hypothetical protein  45.89 
 
 		 150 aa  147  8e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000579412  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1852  hypothetical protein  55.56 
 
 		 172 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000309219  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2213  hypothetical protein  42.33 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000117467  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1984  hypothetical protein  45.75 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000029351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1790  hypothetical protein  41.04 
 
 		 150 aa  115  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0036932  normal  0.183021 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0904  hypothetical protein  25.68 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000194814  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0988  hypothetical protein  26.17 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0918  hypothetical protein  25 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000461903  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02053  hypothetical protein  31.25 
 
 		 133 aa  48.9  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00133062  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1390  hypothetical protein  25.45 
 
 		 158 aa  48.5  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0940  hypothetical protein  23.48 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3249  hypothetical protein  24.77 
 
 		 158 aa  47.8  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00452739  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1271  hypothetical protein  24.77 
 
 		 158 aa  47.8  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0490949  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1997  putative lipoprotein  26.49 
 
 		 157 aa  47.4  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.481992  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0369  hypothetical protein  22.68 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0043  hypothetical protein  26.15 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.761972  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>