20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1997 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1997  putative lipoprotein  100 
 
 		 157 aa  322  1e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.481992  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1852  hypothetical protein  29.01 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000309219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2200  hypothetical protein  29.37 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0036966  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2213  hypothetical protein  29.37 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00174935  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2009  hypothetical protein  29.32 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000579412  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4486  hypothetical protein  29.37 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1960  hypothetical protein  31.21 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.616556  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1790  hypothetical protein  32.43 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0036932  normal  0.183021 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1984  hypothetical protein  26.99 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000029351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2171  hypothetical protein  32.65 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00980217  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2426  hypothetical protein  29.13 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0117545  hitchhiker  0.0000688315 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2221  hypothetical protein  32.65 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000880424  normal  0.25123 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2210  hypothetical protein  28 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.120945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2213  hypothetical protein  28.95 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000117467  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0940  hypothetical protein  32.84 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2365  hypothetical protein  27.03 
 
 		 161 aa  47.8  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2106  hypothetical protein  26.49 
 
 		 161 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121868  normal  0.452338 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02053  hypothetical protein  34.85 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00133062  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1970  hypothetical protein  31.63 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000508823  hitchhiker  0.00854934 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2005  hypothetical protein  31.63 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00021351  hitchhiker  0.000000141582 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>