26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1790 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1790  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  311  1.9999999999999998e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0036932  normal  0.183021 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1984  hypothetical protein  45.34 
 
 		 165 aa  141  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000029351  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2365  hypothetical protein  44.97 
 
 		 161 aa  131  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2200  hypothetical protein  46.71 
 
 		 150 aa  129  9e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0036966  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2213  hypothetical protein  47.48 
 
 		 150 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00174935  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4486  hypothetical protein  47.48 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2221  hypothetical protein  49.29 
 
 		 161 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000880424  normal  0.25123 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2171  hypothetical protein  47.48 
 
 		 161 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00980217  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2210  hypothetical protein  42.96 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.120945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2005  hypothetical protein  41.61 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00021351  hitchhiker  0.000000141582 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1970  hypothetical protein  41.61 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000508823  hitchhiker  0.00854934 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2106  hypothetical protein  39.86 
 
 		 161 aa  120  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121868  normal  0.452338 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2009  hypothetical protein  41.91 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000579412  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2426  hypothetical protein  41.18 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0117545  hitchhiker  0.0000688315 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2213  hypothetical protein  40.74 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000117467  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1852  hypothetical protein  47.79 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000309219  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1960  hypothetical protein  38.46 
 
 		 151 aa  110  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.616556  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0940  hypothetical protein  28.46 
 
 		 159 aa  57  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1997  putative lipoprotein  30.63 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.481992  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1137  hypothetical protein  23.64 
 
 		 148 aa  50.4  0.000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0043  hypothetical protein  23.14 
 
 		 164 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.761972  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0988  hypothetical protein  22.86 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0918  hypothetical protein  22.14 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000461903  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0904  hypothetical protein  23.08 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000194814  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0924  hypothetical protein  24.3 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000155714  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1390  hypothetical protein  25.66 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>