21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0940 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0940  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  323  7e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1790  hypothetical protein  28.46 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0036932  normal  0.183021 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2210  hypothetical protein  28.57 
 
 
141 aa  50.8  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.120945  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2213  hypothetical protein  30.56 
 
 
165 aa  50.8  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000117467  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2365  hypothetical protein  26.53 
 
 
161 aa  50.4  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2005  hypothetical protein  31.15 
 
 
161 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00021351  hitchhiker  0.000000141582 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1970  hypothetical protein  31.15 
 
 
161 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000508823  hitchhiker  0.00854934 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1984  hypothetical protein  24.18 
 
 
165 aa  49.7  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000029351  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1960  hypothetical protein  31.25 
 
 
151 aa  49.7  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.616556  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2171  hypothetical protein  25.53 
 
 
161 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00980217  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1997  putative lipoprotein  32.84 
 
 
157 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.481992  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2426  hypothetical protein  28.41 
 
 
154 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0117545  hitchhiker  0.0000688315 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2106  hypothetical protein  23.48 
 
 
161 aa  48.5  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121868  normal  0.452338 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2221  hypothetical protein  24.47 
 
 
161 aa  48.1  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000880424  normal  0.25123 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2213  hypothetical protein  32.79 
 
 
150 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00174935  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2200  hypothetical protein  32.79 
 
 
150 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0036966  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4486  hypothetical protein  32.79 
 
 
161 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2009  hypothetical protein  25 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000579412  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02053  hypothetical protein  42.55 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00133062  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1562  hypothetical protein  29.73 
 
 
151 aa  45.8  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0130352  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1852  hypothetical protein  24.24 
 
 
172 aa  43.9  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000309219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>