26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2009 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_2009  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  311  1.9999999999999998e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000579412  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2426  hypothetical protein  46.85 
 
 
154 aa  153  9e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0117545  hitchhiker  0.0000688315 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1984  hypothetical protein  47.47 
 
 
165 aa  152  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000029351  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2213  hypothetical protein  44.67 
 
 
165 aa  147  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000117467  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2106  hypothetical protein  45.89 
 
 
161 aa  147  6e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121868  normal  0.452338 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2005  hypothetical protein  47.1 
 
 
161 aa  146  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00021351  hitchhiker  0.000000141582 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1970  hypothetical protein  47.1 
 
 
161 aa  146  7e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000508823  hitchhiker  0.00854934 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2210  hypothetical protein  45.59 
 
 
141 aa  147  7e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.120945  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2200  hypothetical protein  44.37 
 
 
150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0036966  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2213  hypothetical protein  44.37 
 
 
150 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00174935  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4486  hypothetical protein  44.37 
 
 
161 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2221  hypothetical protein  43.66 
 
 
161 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000880424  normal  0.25123 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2171  hypothetical protein  43.66 
 
 
161 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00980217  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1852  hypothetical protein  51.28 
 
 
172 aa  137  6e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000309219  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1960  hypothetical protein  43.33 
 
 
151 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.616556  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2365  hypothetical protein  41.13 
 
 
161 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1790  hypothetical protein  41.48 
 
 
150 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0036932  normal  0.183021 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1997  putative lipoprotein  29.32 
 
 
157 aa  58.2  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.481992  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1390  hypothetical protein  28.57 
 
 
158 aa  51.6  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3249  hypothetical protein  27.62 
 
 
158 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00452739  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1271  hypothetical protein  27.62 
 
 
158 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0490949  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0940  hypothetical protein  25 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1922  hypothetical protein  24.83 
 
 
164 aa  45.1  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02053  hypothetical protein  32.88 
 
 
133 aa  44.3  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00133062  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0369  hypothetical protein  25.23 
 
 
158 aa  43.5  0.0009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1137  hypothetical protein  24.53 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>