26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2213 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2213  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  339  9e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000117467  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2210  hypothetical protein  50 
 
 		 141 aa  155  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.120945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2426  hypothetical protein  47.22 
 
 		 154 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0117545  hitchhiker  0.0000688315 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2009  hypothetical protein  44.67 
 
 		 150 aa  147  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000579412  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2365  hypothetical protein  42.33 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1984  hypothetical protein  43.56 
 
 		 165 aa  144  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000029351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2171  hypothetical protein  42.68 
 
 		 161 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00980217  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2106  hypothetical protein  42.33 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121868  normal  0.452338 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2221  hypothetical protein  42.68 
 
 		 161 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000880424  normal  0.25123 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4486  hypothetical protein  41.36 
 
 		 161 aa  140  8e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1970  hypothetical protein  40.49 
 
 		 161 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000508823  hitchhiker  0.00854934 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2005  hypothetical protein  40.49 
 
 		 161 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00021351  hitchhiker  0.000000141582 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2200  hypothetical protein  42.96 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0036966  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2213  hypothetical protein  42.86 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00174935  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1960  hypothetical protein  42.96 
 
 		 151 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.616556  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1790  hypothetical protein  40.74 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0036932  normal  0.183021 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1852  hypothetical protein  42.74 
 
 		 172 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000309219  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0940  hypothetical protein  30.56 
 
 		 159 aa  50.8  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0043  hypothetical protein  24.17 
 
 		 164 aa  50.8  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.761972  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1997  putative lipoprotein  28.95 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.481992  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3142  hypothetical protein  30 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00589306  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02053  hypothetical protein  30.25 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00133062  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0795  membrane protein  28.26 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1922  hypothetical protein  23.19 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0918  hypothetical protein  21.74 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000461903  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0988  hypothetical protein  21.74 
 
 		 150 aa  40.8  0.009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>