28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0988 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0988  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  301  2.0000000000000002e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0918  hypothetical protein  96 
 
 
150 aa  292  1e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000461903  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0904  hypothetical protein  95.33 
 
 
150 aa  291  2e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000194814  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1137  hypothetical protein  46.53 
 
 
148 aa  140  8e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0986  hypothetical protein  41.38 
 
 
156 aa  108  3e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0916  hypothetical protein  40.69 
 
 
156 aa  105  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000183143  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0924  hypothetical protein  32.9 
 
 
155 aa  98.2  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000155714  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0871  hypothetical protein  38.26 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0035  putative periplasmic protein  32.23 
 
 
137 aa  72  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0479  putative periplasmic protein  36.13 
 
 
122 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2005  hypothetical protein  27.52 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00021351  hitchhiker  0.000000141582 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1970  hypothetical protein  27.52 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000508823  hitchhiker  0.00854934 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2106  hypothetical protein  26.17 
 
 
161 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121868  normal  0.452338 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2365  hypothetical protein  24.67 
 
 
161 aa  55.1  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2221  hypothetical protein  26.23 
 
 
161 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000880424  normal  0.25123 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2171  hypothetical protein  26.23 
 
 
161 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00980217  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0043  hypothetical protein  23.48 
 
 
164 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.761972  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1960  hypothetical protein  23.65 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.616556  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1922  hypothetical protein  26.76 
 
 
164 aa  48.5  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4486  hypothetical protein  23.88 
 
 
161 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2200  hypothetical protein  23.88 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0036966  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2213  hypothetical protein  23.88 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00174935  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1790  hypothetical protein  23.33 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0036932  normal  0.183021 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1852  hypothetical protein  24.27 
 
 
172 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000309219  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1562  hypothetical protein  22.38 
 
 
151 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0130352  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2210  hypothetical protein  26.67 
 
 
141 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.120945  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2213  hypothetical protein  21.74 
 
 
165 aa  40.8  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000117467  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0369  hypothetical protein  25 
 
 
158 aa  40  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>