24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1137 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1137  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  301  2.0000000000000002e-81  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0988  hypothetical protein  46.53 
 
 		 150 aa  140  8e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0904  hypothetical protein  46.53 
 
 		 150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000194814  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0918  hypothetical protein  45.83 
 
 		 150 aa  137  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000461903  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0924  hypothetical protein  32.47 
 
 		 155 aa  92.8  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000155714  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0986  hypothetical protein  38.02 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0916  hypothetical protein  36.36 
 
 		 156 aa  89.4  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000183143  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0035  putative periplasmic protein  39.82 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0871  hypothetical protein  33.58 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0479  putative periplasmic protein  30.19 
 
 		 122 aa  50.8  0.000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1790  hypothetical protein  23.64 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0036932  normal  0.183021 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1984  hypothetical protein  23.66 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000029351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2200  hypothetical protein  25.2 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0036966  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4486  hypothetical protein  25.2 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2213  hypothetical protein  25 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00174935  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2171  hypothetical protein  28.57 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00980217  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2221  hypothetical protein  28.57 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000880424  normal  0.25123 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0369  hypothetical protein  27.78 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1922  hypothetical protein  24.74 
 
 		 164 aa  41.6  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2009  hypothetical protein  24.53 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000579412  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1852  hypothetical protein  21.35 
 
 		 172 aa  40.8  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000309219  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1970  hypothetical protein  25.27 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000508823  hitchhiker  0.00854934 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2005  hypothetical protein  25.27 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00021351  hitchhiker  0.000000141582 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1960  hypothetical protein  24.77 
 
 		 151 aa  40.4  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.616556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>