36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0369 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0369  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  330  4e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1576  hypothetical protein  29.05 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.678852  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1816  hypothetical protein  30.33 
 
 
172 aa  63.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.103062  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2426  hypothetical protein  28.57 
 
 
154 aa  61.2  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0117545  hitchhiker  0.0000688315 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1922  hypothetical protein  31.29 
 
 
164 aa  61.2  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0043  hypothetical protein  24.58 
 
 
164 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.761972  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1812  hypothetical protein  32.38 
 
 
142 aa  54.3  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.639784  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1577  hypothetical protein  31.09 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2221  hypothetical protein  23.97 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000880424  normal  0.25123 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2171  hypothetical protein  23.97 
 
 
161 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00980217  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1984  hypothetical protein  26.32 
 
 
165 aa  51.2  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000029351  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1368  hypothetical protein  30.91 
 
 
142 aa  50.8  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.963563  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3142  hypothetical protein  26.57 
 
 
163 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00589306  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2080  hypothetical protein  27.52 
 
 
141 aa  49.7  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.210886  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0782  hypothetical protein  24.22 
 
 
157 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0323619  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4486  hypothetical protein  24.56 
 
 
161 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2200  hypothetical protein  24.56 
 
 
150 aa  48.5  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0036966  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2213  hypothetical protein  24.56 
 
 
150 aa  48.5  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00174935  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2210  hypothetical protein  24.32 
 
 
141 aa  47.4  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.120945  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2106  hypothetical protein  22.68 
 
 
161 aa  47  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121868  normal  0.452338 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1970  hypothetical protein  25 
 
 
161 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000508823  hitchhiker  0.00854934 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2005  hypothetical protein  25 
 
 
161 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00021351  hitchhiker  0.000000141582 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1960  hypothetical protein  26.5 
 
 
151 aa  47  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.616556  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1390  hypothetical protein  29.57 
 
 
158 aa  47  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0871  hypothetical protein  33.68 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0924  hypothetical protein  30.53 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000155714  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2009  hypothetical protein  25.23 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000579412  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1137  hypothetical protein  27.78 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2365  hypothetical protein  23.08 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1852  hypothetical protein  21.62 
 
 
172 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000309219  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0479  putative periplasmic protein  28.43 
 
 
122 aa  42  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0918  hypothetical protein  25.89 
 
 
150 aa  42  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000461903  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0904  hypothetical protein  25 
 
 
150 aa  41.2  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000194814  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0095  hypothetical protein  26.23 
 
 
140 aa  40.8  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100941  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3249  hypothetical protein  23.89 
 
 
158 aa  40.8  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00452739  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1271  hypothetical protein  23.89 
 
 
158 aa  40.8  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0490949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>