267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1005 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3292  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  94.63 
 
 
335 aa  659    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1005  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  100 
 
 
335 aa  688    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.432024  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1099  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  94.63 
 
 
335 aa  659    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0587643 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0997  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  93.73 
 
 
335 aa  655    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.961901  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1066  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  93.13 
 
 
335 aa  653    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0167374  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3012  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  93.43 
 
 
335 aa  622  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.615219  normal  0.0264263 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3092  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  92.84 
 
 
335 aa  619  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0179342  normal  0.489263 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3189  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  93.13 
 
 
335 aa  619  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.480893 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3599  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  92.72 
 
 
335 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0065  thiosulfate ABC transporter, periplasmic thiosulfate-binding protein  81.82 
 
 
333 aa  564  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0652  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  74.32 
 
 
337 aa  520  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1373  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  63.47 
 
 
334 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3457  thiosulfate transporter subunit  63.52 
 
 
340 aa  402  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2769  thiosulfate transporter subunit  60.55 
 
 
345 aa  402  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135265 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1299  thiosulfate transporter subunit  60.55 
 
 
345 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1408  thiosulfate transporter subunit  60.55 
 
 
345 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2680  thiosulfate transporter subunit  59.58 
 
 
338 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.886764  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0765  thiosulfate transporter subunit  61.59 
 
 
342 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02325  thiosulfate transporter subunit  61.89 
 
 
338 aa  395  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1254  thiosulfate transporter subunit  61.89 
 
 
338 aa  395  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00675829 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2638  thiosulfate transporter subunit  61.89 
 
 
338 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.461248  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02286  hypothetical protein  61.89 
 
 
338 aa  395  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2951  thiosulfate transporter subunit  59.33 
 
 
337 aa  397  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.339938 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2810  thiosulfate transporter subunit  59.28 
 
 
338 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2589  thiosulfate transporter subunit  58.98 
 
 
338 aa  394  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2704  thiosulfate transporter subunit  59.28 
 
 
338 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2561  thiosulfate transporter subunit  61.89 
 
 
338 aa  395  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3655  thiosulfate transporter subunit  61.89 
 
 
338 aa  395  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1002  thiosulfate transporter subunit  61.89 
 
 
342 aa  396  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.428472  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2580  thiosulfate transporter subunit  61.89 
 
 
338 aa  395  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1236  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  61.56 
 
 
338 aa  394  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2797  thiosulfate transporter subunit  61.24 
 
 
338 aa  392  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2711  thiosulfate transporter subunit  61.56 
 
 
338 aa  394  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1398  thiosulphate-binding protein  62.75 
 
 
336 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1378  thiosulphate-binding protein  60.49 
 
 
335 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4018  thiosulphate-binding protein  59.75 
 
 
335 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.206129  normal  0.132982 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1854  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  56.97 
 
 
334 aa  363  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.334824  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3333  thiosulphate-binding protein  60.13 
 
 
345 aa  360  2e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.885845  normal  0.45738 
 
 
-
 
NC_004310  BR1330  sulfate ABC transporter, sulfate-binding protein, putative  57.19 
 
 
334 aa  355  5e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.4153  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1290  putative sulfate ABC transporter, sulfate-binding protein  56.86 
 
 
334 aa  353  2e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1798  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  56.77 
 
 
332 aa  343  2.9999999999999997e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.655228  normal  0.152141 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3697  ABC sulfate/thiosulfate transporter, periplasmic binding protein CysP  55.88 
 
 
330 aa  334  1e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3432  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.88 
 
 
330 aa  334  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.400629 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4318  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.49 
 
 
338 aa  331  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.980547  normal  0.223876 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0169  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  50.93 
 
 
341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3894  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  49.85 
 
 
337 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0402445  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1906  thiosulphate-binding protein  51.8 
 
 
337 aa  323  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000896115  hitchhiker  0.00000000124986 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0620  thiosulphate-binding protein  50 
 
 
336 aa  323  3e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000295034  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31720  Sulfate-binding precursor protein  51.45 
 
 
332 aa  323  3e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4345  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.13 
 
 
332 aa  322  5e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2331  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.37 
 
 
345 aa  322  7e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0899  sulfate starvation-induced protein 2  51.29 
 
 
338 aa  322  8e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.368441  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2134  thiosulphate-binding protein  50.62 
 
 
331 aa  321  9.999999999999999e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-21  decreased coverage  0.000103932 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2470  ABC sulfate/thiosulfate transporter, periplasmic ligand binding protein, CysP  52.9 
 
 
346 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0297151  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0123  thiosulfate binding protein  48.02 
 
 
337 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000442607 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0614  thiosulphate-binding protein  48.61 
 
 
329 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.772188 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2992  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.13 
 
 
339 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3804  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  50.48 
 
 
337 aa  317  3e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0560  sulfate-binding protein precursor  51.46 
 
 
337 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0392  sulfate/thiosulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.46 
 
 
337 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0507  thiosulphate-binding protein  46.87 
 
 
330 aa  316  3e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.347365  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0371  sulfate/thiosulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.46 
 
 
337 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.597645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2531  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48.87 
 
 
356 aa  316  4e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000783626  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03700  sulfate-binding protein precursor  49.68 
 
 
332 aa  315  8e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000120397 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0733  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.83 
 
 
337 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45110  sulfate-binding protein of ABC transporter  48.53 
 
 
332 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0443  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48.45 
 
 
341 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2061  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.16 
 
 
331 aa  313  2.9999999999999996e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.647625  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4267  sulfate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  49.35 
 
 
341 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3839  sulfate-binding protein of ABC transporter  48.53 
 
 
332 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0374  sulfate-binding protein precursor  49.04 
 
 
332 aa  311  9e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5078  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.92 
 
 
335 aa  311  9e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151813  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5231  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.62 
 
 
335 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.297946  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0325  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  50.81 
 
 
337 aa  311  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1578  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  52.09 
 
 
345 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1121  thiosulphate-binding protein  52.09 
 
 
345 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1601  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  52.09 
 
 
345 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0107  sulfate ABC transporter, sulfate-binding protein  46.83 
 
 
342 aa  309  4e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3870  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.57 
 
 
332 aa  308  8e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4641  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48.92 
 
 
340 aa  308  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.869357  hitchhiker  0.00000640821 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3632  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.57 
 
 
332 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4652  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.88 
 
 
337 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1552  thiosulphate-binding protein  45.85 
 
 
335 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2422  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.26 
 
 
343 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1346  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  49.35 
 
 
337 aa  306  3e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4118  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.22 
 
 
359 aa  306  3e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000140992  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4305  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.25 
 
 
332 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0291  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.02 
 
 
335 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.483831 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1723  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  50.16 
 
 
329 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000440935  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5171  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.02 
 
 
342 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138843  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4739  thiosulphate-binding protein  51.45 
 
 
345 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0623695  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1517  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.45 
 
 
345 aa  305  6e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3560  thiosulphate-binding protein  46.69 
 
 
329 aa  305  6e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1497  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.45 
 
 
345 aa  305  6e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1636  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.45 
 
 
345 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.778191  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1591  thiosulphate-binding protein  44.85 
 
 
332 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00740648  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2480  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  52.43 
 
 
345 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3383  extracellular solute-binding protein  47.21 
 
 
341 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4461  sulfate transporter subunit  46.93 
 
 
329 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0120  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.96 
 
 
342 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>