270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3457 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3457  thiosulfate transporter subunit  100 
 
 
340 aa  704    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1408  thiosulfate transporter subunit  81.74 
 
 
345 aa  573  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1299  thiosulfate transporter subunit  81.74 
 
 
345 aa  573  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2769  thiosulfate transporter subunit  81.74 
 
 
345 aa  573  1.0000000000000001e-162  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135265 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0765  thiosulfate transporter subunit  77.88 
 
 
342 aa  547  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1002  thiosulfate transporter subunit  77.58 
 
 
342 aa  545  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.428472  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2951  thiosulfate transporter subunit  76.49 
 
 
337 aa  533  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.339938 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02325  thiosulfate transporter subunit  78.55 
 
 
338 aa  526  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1236  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  78.23 
 
 
338 aa  524  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3655  thiosulfate transporter subunit  78.55 
 
 
338 aa  526  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2561  thiosulfate transporter subunit  78.55 
 
 
338 aa  526  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02286  hypothetical protein  78.55 
 
 
338 aa  526  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2711  thiosulfate transporter subunit  78.23 
 
 
338 aa  524  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1254  thiosulfate transporter subunit  78.55 
 
 
338 aa  526  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00675829 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2580  thiosulfate transporter subunit  78.55 
 
 
338 aa  526  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2589  thiosulfate transporter subunit  77.99 
 
 
338 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2704  thiosulfate transporter subunit  77.99 
 
 
338 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2810  thiosulfate transporter subunit  77.99 
 
 
338 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2680  thiosulfate transporter subunit  77.99 
 
 
338 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.886764  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2797  thiosulfate transporter subunit  77.92 
 
 
338 aa  522  1e-147  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2638  thiosulfate transporter subunit  77.67 
 
 
338 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.461248  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3292  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  64.17 
 
 
335 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1099  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  64.17 
 
 
335 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0587643 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1066  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  64.17 
 
 
335 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0167374  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3012  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  64.5 
 
 
335 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.615219  normal  0.0264263 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3092  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  64.5 
 
 
335 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0179342  normal  0.489263 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3189  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  64.5 
 
 
335 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.480893 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3599  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  63.84 
 
 
335 aa  401  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0652  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  59.28 
 
 
337 aa  404  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1005  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  63.52 
 
 
335 aa  402  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.432024  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0065  thiosulfate ABC transporter, periplasmic thiosulfate-binding protein  62.23 
 
 
333 aa  402  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0997  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  63.19 
 
 
335 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.961901  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1373  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  59.01 
 
 
334 aa  393  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1854  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  58.08 
 
 
334 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.334824  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1378  thiosulphate-binding protein  58.2 
 
 
335 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1330  sulfate ABC transporter, sulfate-binding protein, putative  58.63 
 
 
334 aa  372  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.4153  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1398  thiosulphate-binding protein  57.84 
 
 
336 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1290  putative sulfate ABC transporter, sulfate-binding protein  58.31 
 
 
334 aa  370  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4018  thiosulphate-binding protein  57.52 
 
 
335 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.206129  normal  0.132982 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3333  thiosulphate-binding protein  55.87 
 
 
345 aa  345  6e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.885845  normal  0.45738 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0614  thiosulphate-binding protein  51.68 
 
 
329 aa  339  5e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.772188 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4318  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.76 
 
 
338 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.980547  normal  0.223876 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2331  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.59 
 
 
345 aa  335  9e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1906  thiosulphate-binding protein  51.78 
 
 
337 aa  332  4e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000896115  hitchhiker  0.00000000124986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4267  sulfate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  50.61 
 
 
341 aa  331  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0443  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  49.7 
 
 
341 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1346  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  50.8 
 
 
337 aa  322  5e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3697  ABC sulfate/thiosulfate transporter, periplasmic binding protein CysP  51.47 
 
 
330 aa  321  9.000000000000001e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3432  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.47 
 
 
330 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.400629 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3894  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  49.84 
 
 
337 aa  320  3e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0402445  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1723  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  49.68 
 
 
329 aa  316  3e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000440935  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4305  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48.87 
 
 
332 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1798  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.43 
 
 
332 aa  315  7e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.655228  normal  0.152141 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3400  thiosulphate-binding protein  45.85 
 
 
354 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0940818  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1799  sulfate adenylyltransferase, large subunit  48.87 
 
 
807 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0169  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  49.35 
 
 
341 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3804  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  50.49 
 
 
337 aa  313  2.9999999999999996e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0325  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  49.35 
 
 
337 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02518  ABC transporter sulfate binding protein  46.22 
 
 
365 aa  311  1e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.607163  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1336  sulfate-binding precursor signal peptide protein  48.11 
 
 
336 aa  310  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.533362  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3870  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.59 
 
 
332 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1552  thiosulphate-binding protein  47.02 
 
 
335 aa  310  2e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1394  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  50.16 
 
 
338 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3632  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.9 
 
 
332 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2992  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48.7 
 
 
339 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1591  thiosulphate-binding protein  45.76 
 
 
332 aa  308  9e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00740648  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5479  sulfate adenylyltransferase, large subunit  48.54 
 
 
798 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0197363  decreased coverage  0.00943774 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03802  sulfate transporter subunit  47.48 
 
 
329 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4068  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.48 
 
 
329 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4101  sulfate transporter subunit  47.48 
 
 
329 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5372  sulfate transporter subunit  47.8 
 
 
329 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0392  sulfate/thiosulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48.7 
 
 
337 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0560  sulfate-binding protein precursor  48.7 
 
 
337 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4357  sulfate transporter subunit  47.48 
 
 
329 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.427406 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4148  sulfate transporter subunit  47.48 
 
 
329 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03751  hypothetical protein  47.48 
 
 
329 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0371  sulfate/thiosulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48.7 
 
 
337 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.597645  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1211  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.93 
 
 
339 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0110956  normal  0.0538246 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4451  sulfate transporter subunit  47.48 
 
 
329 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2134  thiosulphate-binding protein  48.92 
 
 
331 aa  306  3e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-21  decreased coverage  0.000103932 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1978  thiosulphate-binding protein  49.84 
 
 
335 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4410  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.44 
 
 
342 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.476755  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4397  sulfate transporter subunit  47.17 
 
 
329 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1274  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.32 
 
 
339 aa  305  9.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0123  thiosulfate binding protein  46.81 
 
 
337 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000442607 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4806  sulfate transporter subunit  49.53 
 
 
331 aa  303  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000221787 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0556  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.62 
 
 
349 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1450  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.15 
 
 
343 aa  303  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.601582  normal  0.754893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1565  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48.23 
 
 
332 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105023  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0194  thiosulphate-binding protein  45.54 
 
 
337 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.648325  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45110  sulfate-binding protein of ABC transporter  47.88 
 
 
332 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4280  sulfate transporter subunit  47.48 
 
 
329 aa  302  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0399629  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2470  ABC sulfate/thiosulfate transporter, periplasmic ligand binding protein, CysP  48.58 
 
 
346 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0297151  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0581  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  43.95 
 
 
355 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.105531  normal  0.906186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0592  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  43.95 
 
 
355 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.347338 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3839  sulfate-binding protein of ABC transporter  47.88 
 
 
332 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0899  sulfate starvation-induced protein 2  47.47 
 
 
338 aa  300  2e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.368441  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4461  sulfate transporter subunit  47.17 
 
 
329 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2061  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.75 
 
 
331 aa  300  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.647625  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2105  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.59 
 
 
341 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>