262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2797 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02325  thiosulfate transporter subunit  99.11 
 
 
338 aa  692    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1236  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  99.11 
 
 
338 aa  691    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1254  thiosulfate transporter subunit  99.41 
 
 
338 aa  693    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00675829 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3655  thiosulfate transporter subunit  99.41 
 
 
338 aa  693    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2711  thiosulfate transporter subunit  99.11 
 
 
338 aa  691    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2680  thiosulfate transporter subunit  94.66 
 
 
338 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.886764  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2638  thiosulfate transporter subunit  94.96 
 
 
338 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.461248  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2951  thiosulfate transporter subunit  91.39 
 
 
337 aa  640    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.339938 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2704  thiosulfate transporter subunit  94.96 
 
 
338 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2580  thiosulfate transporter subunit  99.41 
 
 
338 aa  693    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2561  thiosulfate transporter subunit  99.41 
 
 
338 aa  693    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2810  thiosulfate transporter subunit  94.66 
 
 
338 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02286  hypothetical protein  99.11 
 
 
338 aa  692    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2797  thiosulfate transporter subunit  100 
 
 
338 aa  697    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2589  thiosulfate transporter subunit  94.66 
 
 
338 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0765  thiosulfate transporter subunit  80.32 
 
 
342 aa  539  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1002  thiosulfate transporter subunit  79.68 
 
 
342 aa  536  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.428472  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3457  thiosulfate transporter subunit  77.23 
 
 
340 aa  530  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2769  thiosulfate transporter subunit  73.55 
 
 
345 aa  522  1e-147  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135265 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1299  thiosulfate transporter subunit  73.76 
 
 
345 aa  522  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1408  thiosulfate transporter subunit  73.55 
 
 
345 aa  522  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0652  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.12 
 
 
337 aa  409  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1099  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.69 
 
 
335 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0587643 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1005  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  58.28 
 
 
335 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.432024  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3012  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  62.54 
 
 
335 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.615219  normal  0.0264263 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3092  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  62.54 
 
 
335 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0179342  normal  0.489263 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3292  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.69 
 
 
335 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3189  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  62.54 
 
 
335 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.480893 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3599  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  62.21 
 
 
335 aa  395  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0065  thiosulfate ABC transporter, periplasmic thiosulfate-binding protein  60 
 
 
333 aa  397  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1066  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.4 
 
 
335 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0167374  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0997  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.1 
 
 
335 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.961901  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1373  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.1 
 
 
334 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1378  thiosulphate-binding protein  55.99 
 
 
335 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1854  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  58.39 
 
 
334 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.334824  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1398  thiosulphate-binding protein  57.1 
 
 
336 aa  362  4e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4018  thiosulphate-binding protein  54.44 
 
 
335 aa  362  4e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.206129  normal  0.132982 
 
 
-
 
NC_004310  BR1330  sulfate ABC transporter, sulfate-binding protein, putative  56.45 
 
 
334 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.4153  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1290  putative sulfate ABC transporter, sulfate-binding protein  56.13 
 
 
334 aa  355  5.999999999999999e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3333  thiosulphate-binding protein  57.01 
 
 
345 aa  354  1e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.885845  normal  0.45738 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4318  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  52.94 
 
 
338 aa  341  8e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.980547  normal  0.223876 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0614  thiosulphate-binding protein  52.01 
 
 
329 aa  332  6e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.772188 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2331  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.9 
 
 
345 aa  329  3e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1798  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  53.75 
 
 
332 aa  327  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.655228  normal  0.152141 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1906  thiosulphate-binding protein  50 
 
 
337 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000896115  hitchhiker  0.00000000124986 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45110  sulfate-binding protein of ABC transporter  49.51 
 
 
332 aa  317  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1346  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  50.32 
 
 
337 aa  316  4e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3839  sulfate-binding protein of ABC transporter  49.19 
 
 
332 aa  316  4e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0733  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  49.85 
 
 
337 aa  315  8e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3432  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.14 
 
 
330 aa  315  9e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.400629 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0169  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48.61 
 
 
341 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3697  ABC sulfate/thiosulfate transporter, periplasmic binding protein CysP  50.81 
 
 
330 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4267  sulfate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  48.31 
 
 
341 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0443  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  49.22 
 
 
341 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3894  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  50.3 
 
 
337 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0402445  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02518  ABC transporter sulfate binding protein  46.65 
 
 
365 aa  312  5.999999999999999e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.607163  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1211  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.6 
 
 
339 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0110956  normal  0.0538246 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4652  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48.78 
 
 
337 aa  311  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0325  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  49.04 
 
 
337 aa  311  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0123  thiosulfate binding protein  47.58 
 
 
337 aa  311  1e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000442607 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1274  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.01 
 
 
339 aa  309  4e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0392  sulfate/thiosulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48.7 
 
 
337 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0560  sulfate-binding protein precursor  48.7 
 
 
337 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0371  sulfate/thiosulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48.7 
 
 
337 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.597645  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1336  sulfate-binding precursor signal peptide protein  48.73 
 
 
336 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.533362  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2992  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48.7 
 
 
339 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3804  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  50.16 
 
 
337 aa  305  9.000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1723  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  49.2 
 
 
329 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000440935  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1799  sulfate adenylyltransferase, large subunit  48.41 
 
 
807 aa  301  9e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2470  ABC sulfate/thiosulfate transporter, periplasmic ligand binding protein, CysP  47.78 
 
 
346 aa  301  9e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0297151  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1978  thiosulphate-binding protein  50.16 
 
 
335 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2061  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.55 
 
 
331 aa  300  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.647625  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1552  thiosulphate-binding protein  48.48 
 
 
335 aa  300  2e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4554  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  49.35 
 
 
350 aa  300  2e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2105  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.95 
 
 
341 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30540  Sulfate ABC transporter-binding component-CysP-like protein  47.55 
 
 
332 aa  300  3e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2940  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  49.35 
 
 
363 aa  299  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4055  sulfate transporter subunit  46.13 
 
 
329 aa  299  5e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.868359  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4410  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.12 
 
 
342 aa  299  5e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.476755  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1394  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  49.19 
 
 
338 aa  299  6e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5372  sulfate transporter subunit  46.13 
 
 
329 aa  298  6e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03802  sulfate transporter subunit  45.82 
 
 
329 aa  298  8e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4068  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.82 
 
 
329 aa  298  8e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4148  sulfate transporter subunit  45.82 
 
 
329 aa  298  8e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4101  sulfate transporter subunit  45.82 
 
 
329 aa  298  8e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03751  hypothetical protein  45.82 
 
 
329 aa  298  8e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4451  sulfate transporter subunit  45.82 
 
 
329 aa  298  8e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4357  sulfate transporter subunit  45.82 
 
 
329 aa  298  8e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.427406 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3383  extracellular solute-binding protein  47.87 
 
 
341 aa  297  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2134  thiosulphate-binding protein  47.98 
 
 
331 aa  298  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-21  decreased coverage  0.000103932 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2966  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  49.35 
 
 
339 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.806732 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3560  thiosulphate-binding protein  47.26 
 
 
329 aa  298  1e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1369  thiosulphate-binding protein  48.21 
 
 
335 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327074  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2196  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.95 
 
 
345 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.559252  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3400  thiosulphate-binding protein  46.48 
 
 
354 aa  297  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0940818  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4280  sulfate transporter subunit  46.13 
 
 
329 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0399629  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4397  sulfate transporter subunit  45.51 
 
 
329 aa  297  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2855  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  49.35 
 
 
339 aa  296  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.674702 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4394  sulfate transporter subunit  46.13 
 
 
329 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.770755  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2945  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  49.35 
 
 
339 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>