264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0169 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0169  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  100 
 
 
341 aa  699    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0443  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  84.46 
 
 
341 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4267  sulfate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  82.99 
 
 
341 aa  600  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0392  sulfate/thiosulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  82.96 
 
 
337 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0560  sulfate-binding protein precursor  82.96 
 
 
337 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0371  sulfate/thiosulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  82.96 
 
 
337 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.597645  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0325  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  83.28 
 
 
337 aa  550  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2992  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  82.32 
 
 
339 aa  544  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2940  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  82.32 
 
 
363 aa  528  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2966  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  82.96 
 
 
339 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.806732 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2331  thiosulphate-binding protein  83.28 
 
 
339 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0147593  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2945  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  83.28 
 
 
339 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2855  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  82.32 
 
 
339 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.674702 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6297  ABC thiosulphate transporter, periplasmic ligand binding protein  82.64 
 
 
339 aa  525  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0614  thiosulphate-binding protein  64.89 
 
 
329 aa  437  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.772188 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0123  thiosulfate binding protein  59.94 
 
 
337 aa  401  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000442607 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2134  thiosulphate-binding protein  59.63 
 
 
331 aa  394  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-21  decreased coverage  0.000103932 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1274  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  58.39 
 
 
339 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1211  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  58.39 
 
 
339 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0110956  normal  0.0538246 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45110  sulfate-binding protein of ABC transporter  59.74 
 
 
332 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1906  thiosulphate-binding protein  58.96 
 
 
337 aa  384  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000896115  hitchhiker  0.00000000124986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3839  sulfate-binding protein of ABC transporter  59.08 
 
 
332 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0821  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  58.68 
 
 
329 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0561556  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0507  thiosulphate-binding protein  56.39 
 
 
330 aa  379  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.347365  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1369  thiosulphate-binding protein  58.97 
 
 
335 aa  378  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327074  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2961  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.53 
 
 
338 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1346  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  58.31 
 
 
337 aa  375  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0899  sulfate starvation-induced protein 2  58.63 
 
 
338 aa  377  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.368441  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1336  sulfate-binding precursor signal peptide protein  58.39 
 
 
336 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.533362  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3804  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  58.2 
 
 
337 aa  375  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1591  thiosulphate-binding protein  55.21 
 
 
332 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00740648  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1552  thiosulphate-binding protein  57.19 
 
 
335 aa  377  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2376  thiosulphate-binding protein  57.05 
 
 
330 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3894  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.89 
 
 
337 aa  374  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0402445  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1543  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  58.77 
 
 
330 aa  375  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.513686  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3383  extracellular solute-binding protein  58.09 
 
 
341 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4010  thiosulphate-binding protein  54.46 
 
 
329 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.311837 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3560  thiosulphate-binding protein  56.52 
 
 
329 aa  374  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4410  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.65 
 
 
342 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.476755  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1799  sulfate adenylyltransferase, large subunit  57.59 
 
 
807 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3632  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.47 
 
 
332 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3693  thiosulphate-binding protein  54.97 
 
 
332 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1723  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.28 
 
 
329 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000440935  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4461  sulfate transporter subunit  56.56 
 
 
329 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4055  sulfate transporter subunit  57.5 
 
 
329 aa  371  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.868359  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1045  thiosulphate-binding protein  57.65 
 
 
327 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1762  thiosulphate-binding protein  57.1 
 
 
332 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.478994  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5479  sulfate adenylyltransferase, large subunit  56.51 
 
 
798 aa  368  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0197363  decreased coverage  0.00943774 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2470  ABC sulfate/thiosulfate transporter, periplasmic ligand binding protein, CysP  58.15 
 
 
346 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0297151  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4118  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.3 
 
 
359 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000140992  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2105  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.28 
 
 
341 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2531  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  52.85 
 
 
356 aa  371  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000783626  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2422  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.65 
 
 
343 aa  368  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.944907 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03802  sulfate transporter subunit  55.62 
 
 
329 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4148  sulfate transporter subunit  55.62 
 
 
329 aa  367  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4068  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.62 
 
 
329 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4305  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  56.49 
 
 
332 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4101  sulfate transporter subunit  55.62 
 
 
329 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4451  sulfate transporter subunit  55.62 
 
 
329 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4280  sulfate transporter subunit  56.56 
 
 
329 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0399629  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4392  sulfate transporter subunit  56.25 
 
 
329 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  0.694674 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3870  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  56.49 
 
 
332 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0241  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.28 
 
 
331 aa  367  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.276521  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4397  sulfate transporter subunit  55.31 
 
 
329 aa  366  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03751  hypothetical protein  55.62 
 
 
329 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5372  sulfate transporter subunit  55.31 
 
 
329 aa  365  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2196  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  56.96 
 
 
345 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.559252  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0866  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.23 
 
 
334 aa  365  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4357  sulfate transporter subunit  55.62 
 
 
329 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.427406 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4394  sulfate transporter subunit  56.25 
 
 
329 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.770755  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0967  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  53.12 
 
 
337 aa  364  1e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4309  sulfate transporter subunit  57.65 
 
 
329 aa  363  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2545  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  59.54 
 
 
337 aa  363  3e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.437885  normal  0.0124572 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1156  thiosulphate-binding protein  55.94 
 
 
329 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1394  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  59.09 
 
 
338 aa  361  9e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4652  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.99 
 
 
337 aa  360  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1978  thiosulphate-binding protein  59.67 
 
 
335 aa  360  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4590  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  56.96 
 
 
342 aa  360  2e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0733  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  52.34 
 
 
337 aa  359  4e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2061  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  53.42 
 
 
331 aa  359  5e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.647625  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4554  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.7 
 
 
350 aa  357  9.999999999999999e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6977  sulfate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  56.82 
 
 
329 aa  357  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0620  thiosulphate-binding protein  56.13 
 
 
336 aa  355  5e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000295034  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0090  sulfate transporter subunit  55.93 
 
 
329 aa  354  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1519  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.59 
 
 
335 aa  354  1e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.059232  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2338  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.59 
 
 
335 aa  354  1e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0895899  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0089  sulfate transporter subunit  55.62 
 
 
329 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4345  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.59 
 
 
332 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1565  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  56.09 
 
 
332 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105023  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30540  Sulfate ABC transporter-binding component-CysP-like protein  54.82 
 
 
332 aa  351  1e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1378  thiosulphate-binding protein  52.55 
 
 
335 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1044  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  53.23 
 
 
336 aa  350  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3625  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.76 
 
 
332 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.929699  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3315  hypothetical protein  54.58 
 
 
328 aa  349  4e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.227914  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4125  sulfate transporter subunit  57.65 
 
 
329 aa  349  5e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0563  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  53.5 
 
 
341 aa  349  5e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.201199  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4806  sulfate transporter subunit  55.59 
 
 
331 aa  348  7e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000221787 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2760  thiosulphate-binding protein  55.69 
 
 
329 aa  348  8e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0122  thiosulfate binding protein  55.66 
 
 
337 aa  347  1e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.964738  decreased coverage  0.00000712106 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1517  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.46 
 
 
345 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>