35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4173 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4173  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  463  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0333  hypothetical protein  96.86 
 
 
223 aa  449  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.14489 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4090  hypothetical protein  95.96 
 
 
223 aa  445  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0656  hypothetical protein  64.13 
 
 
219 aa  299  3e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3709  hypothetical protein  62.78 
 
 
217 aa  297  7e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1260  putative secreted protein  56.88 
 
 
230 aa  250  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1402  putative secreted protein  56.88 
 
 
230 aa  250  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.147645  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1168  putative secreted protein  56.22 
 
 
230 aa  248  6e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2349  hypothetical protein  56.02 
 
 
230 aa  244  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000252441  unclonable  0.000000139231 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1630  putative secreted protein  55.66 
 
 
226 aa  244  6e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3420  hypothetical protein  56.52 
 
 
229 aa  244  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.827841  normal  0.178813 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1188  hypothetical protein  54.59 
 
 
230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.708151  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4175  putative secreted protein  53.92 
 
 
230 aa  240  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.774266 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2855  hypothetical protein  54.55 
 
 
222 aa  238  4e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0816055  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0439  putative secreted protein  53.39 
 
 
226 aa  236  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2390  hypothetical protein  54.25 
 
 
230 aa  234  9e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.385374  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0952  hypothetical protein  54.03 
 
 
230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2190  hypothetical protein  54.03 
 
 
230 aa  232  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0506  hypothetical protein  55.56 
 
 
233 aa  230  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36240  hypothetical protein  53.43 
 
 
218 aa  229  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1446  hypothetical protein  49.78 
 
 
222 aa  229  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0863  hypothetical protein  50.22 
 
 
222 aa  227  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3019  hypothetical protein  50.46 
 
 
213 aa  222  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0679  hypothetical protein  49.56 
 
 
230 aa  222  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276335  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3326  hypothetical protein  51.43 
 
 
213 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.726467  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2944  hypothetical protein  51.43 
 
 
213 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59900  hypothetical protein  46.85 
 
 
219 aa  203  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.101829  hitchhiker  0.00000000000141059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4511  hypothetical protein  46.4 
 
 
219 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1760  hypothetical protein  44.34 
 
 
212 aa  190  2e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0644  hypothetical protein  46.54 
 
 
225 aa  176  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3930  hypothetical protein  42.25 
 
 
221 aa  148  8e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2759  hypothetical protein  38.79 
 
 
246 aa  134  8e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0281915  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1026  hypothetical protein  22.33 
 
 
218 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1064  hypothetical protein  22.33 
 
 
218 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2388  hypothetical protein  21.57 
 
 
220 aa  42.4  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>