35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2190 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2190  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  472  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0952  hypothetical protein  97.39 
 
 
230 aa  461  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2390  hypothetical protein  97.39 
 
 
230 aa  463  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.385374  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0679  hypothetical protein  83.91 
 
 
230 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276335  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3420  hypothetical protein  76.29 
 
 
229 aa  374  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.827841  normal  0.178813 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1168  putative secreted protein  79.43 
 
 
230 aa  367  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2855  hypothetical protein  77.03 
 
 
222 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0816055  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2349  hypothetical protein  73.91 
 
 
230 aa  367  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000252441  unclonable  0.000000139231 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1402  putative secreted protein  80.86 
 
 
230 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.147645  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1260  putative secreted protein  80.86 
 
 
230 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1188  hypothetical protein  77.99 
 
 
230 aa  362  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.708151  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4175  putative secreted protein  77.03 
 
 
230 aa  361  5.0000000000000005e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.774266 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1630  putative secreted protein  71.74 
 
 
226 aa  357  9e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0439  putative secreted protein  70.87 
 
 
226 aa  354  6.999999999999999e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0506  hypothetical protein  75.11 
 
 
233 aa  340  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1446  hypothetical protein  60.27 
 
 
222 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3019  hypothetical protein  61.72 
 
 
213 aa  277  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36240  hypothetical protein  60.78 
 
 
218 aa  275  4e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2944  hypothetical protein  60.29 
 
 
213 aa  274  8e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3326  hypothetical protein  59.33 
 
 
213 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.726467  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0863  hypothetical protein  60.87 
 
 
222 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0656  hypothetical protein  54.42 
 
 
219 aa  249  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59900  hypothetical protein  56.34 
 
 
219 aa  248  5e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.101829  hitchhiker  0.00000000000141059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4511  hypothetical protein  56.34 
 
 
219 aa  248  6e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3709  hypothetical protein  56.04 
 
 
217 aa  246  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0333  hypothetical protein  53.64 
 
 
223 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.14489 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4090  hypothetical protein  53.64 
 
 
223 aa  232  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4173  hypothetical protein  54.59 
 
 
223 aa  231  8.000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1760  hypothetical protein  50 
 
 
212 aa  222  4e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0644  hypothetical protein  43.95 
 
 
225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2759  hypothetical protein  41.23 
 
 
246 aa  165  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0281915  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3930  hypothetical protein  42.03 
 
 
221 aa  153  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1026  hypothetical protein  23.74 
 
 
218 aa  63.2  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1064  hypothetical protein  23.74 
 
 
218 aa  63.2  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2388  hypothetical protein  22.8 
 
 
220 aa  50.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>