35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0679 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0679  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  474  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0952  hypothetical protein  84.35 
 
 		 230 aa  409  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2390  hypothetical protein  83.91 
 
 		 230 aa  407  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.385374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2190  hypothetical protein  83.91 
 
 		 230 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1402  putative secreted protein  73.91 
 
 		 230 aa  359  2e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.147645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1260  putative secreted protein  73.91 
 
 		 230 aa  359  2e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1168  putative secreted protein  73.48 
 
 		 230 aa  358  4e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2349  hypothetical protein  73.04 
 
 		 230 aa  357  6e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000252441  unclonable  0.000000139231 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2855  hypothetical protein  75.78 
 
 		 222 aa  356  1.9999999999999998e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0816055  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3420  hypothetical protein  72.53 
 
 		 229 aa  355  2.9999999999999997e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.827841  normal  0.178813 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1188  hypothetical protein  72.61 
 
 		 230 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.708151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4175  putative secreted protein  70.87 
 
 		 230 aa  351  5e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.774266 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1630  putative secreted protein  71.74 
 
 		 226 aa  351  7e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0439  putative secreted protein  70.87 
 
 		 226 aa  347  9e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0506  hypothetical protein  71.67 
 
 		 233 aa  327  9e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1446  hypothetical protein  58.22 
 
 		 222 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3019  hypothetical protein  59.33 
 
 		 213 aa  268  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36240  hypothetical protein  57.75 
 
 		 218 aa  268  5e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0863  hypothetical protein  58.45 
 
 		 222 aa  264  8.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2944  hypothetical protein  56.46 
 
 		 213 aa  257  8e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3326  hypothetical protein  55.5 
 
 		 213 aa  255  5e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.726467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4511  hypothetical protein  54.76 
 
 		 219 aa  241  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59900  hypothetical protein  54.76 
 
 		 219 aa  241  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.101829  hitchhiker  0.00000000000141059 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0656  hypothetical protein  53.92 
 
 		 219 aa  238  5e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3709  hypothetical protein  53.62 
 
 		 217 aa  234  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4173  hypothetical protein  52.17 
 
 		 223 aa  219  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0333  hypothetical protein  51.18 
 
 		 223 aa  216  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.14489 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4090  hypothetical protein  51.18 
 
 		 223 aa  216  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1760  hypothetical protein  47.12 
 
 		 212 aa  212  2.9999999999999995e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0644  hypothetical protein  41.78 
 
 		 225 aa  174  7e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2759  hypothetical protein  44.39 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0281915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3930  hypothetical protein  41.06 
 
 		 221 aa  148  9e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1026  hypothetical protein  25.62 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1064  hypothetical protein  25.62 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2388  hypothetical protein  24 
 
 		 220 aa  57  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>