35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0656 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0656  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  453  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3709  hypothetical protein  75.8 
 
 
217 aa  355  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0333  hypothetical protein  64.13 
 
 
223 aa  297  6e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.14489 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4090  hypothetical protein  63.68 
 
 
223 aa  295  4e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4173  hypothetical protein  64.13 
 
 
223 aa  294  7e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2390  hypothetical protein  55.75 
 
 
230 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.385374  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0952  hypothetical protein  54.87 
 
 
230 aa  251  7e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2190  hypothetical protein  54.42 
 
 
230 aa  249  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3420  hypothetical protein  57.28 
 
 
229 aa  246  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.827841  normal  0.178813 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2855  hypothetical protein  57.77 
 
 
222 aa  246  3e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0816055  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1168  putative secreted protein  56.25 
 
 
230 aa  245  4e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1260  putative secreted protein  55.77 
 
 
230 aa  243  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1402  putative secreted protein  55.77 
 
 
230 aa  243  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.147645  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3326  hypothetical protein  58.74 
 
 
213 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.726467  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0506  hypothetical protein  59.22 
 
 
233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4175  putative secreted protein  55.29 
 
 
230 aa  242  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.774266 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2349  hypothetical protein  55.29 
 
 
230 aa  241  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000252441  unclonable  0.000000139231 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1188  hypothetical protein  55.29 
 
 
230 aa  241  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.708151  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2944  hypothetical protein  58.74 
 
 
213 aa  241  5e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1630  putative secreted protein  54.59 
 
 
226 aa  240  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0679  hypothetical protein  53.92 
 
 
230 aa  238  4e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276335  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3019  hypothetical protein  57.28 
 
 
213 aa  236  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0439  putative secreted protein  55.83 
 
 
226 aa  231  6e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36240  hypothetical protein  53.43 
 
 
218 aa  224  8e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1446  hypothetical protein  50.67 
 
 
222 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0863  hypothetical protein  49.1 
 
 
222 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4511  hypothetical protein  47.91 
 
 
219 aa  203  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59900  hypothetical protein  47.91 
 
 
219 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.101829  hitchhiker  0.00000000000141059 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1760  hypothetical protein  46.83 
 
 
212 aa  198  6e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0644  hypothetical protein  47.32 
 
 
225 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3930  hypothetical protein  44.88 
 
 
221 aa  162  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2759  hypothetical protein  37.5 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0281915  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2388  hypothetical protein  24.62 
 
 
220 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1026  hypothetical protein  23.76 
 
 
218 aa  42.7  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1064  hypothetical protein  23.76 
 
 
218 aa  42.7  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>