35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3019 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3019  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  434  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2944  hypothetical protein  84.36 
 
 		 213 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3326  hypothetical protein  83.41 
 
 		 213 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.726467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3420  hypothetical protein  61.79 
 
 		 229 aa  280  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.827841  normal  0.178813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2349  hypothetical protein  61.79 
 
 		 230 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000252441  unclonable  0.000000139231 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1188  hypothetical protein  61.79 
 
 		 230 aa  278  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.708151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1402  putative secreted protein  61.32 
 
 		 230 aa  277  9e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.147645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1260  putative secreted protein  61.32 
 
 		 230 aa  277  9e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2190  hypothetical protein  61.72 
 
 		 230 aa  277  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1168  putative secreted protein  61.79 
 
 		 230 aa  276  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2390  hypothetical protein  61.72 
 
 		 230 aa  276  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.385374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4175  putative secreted protein  60.38 
 
 		 230 aa  274  6e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.774266 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0952  hypothetical protein  60.77 
 
 		 230 aa  274  7e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1446  hypothetical protein  62.14 
 
 		 222 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2855  hypothetical protein  59.24 
 
 		 222 aa  271  6e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0816055  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0506  hypothetical protein  64.08 
 
 		 233 aa  268  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0679  hypothetical protein  59.33 
 
 		 230 aa  268  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1630  putative secreted protein  56.6 
 
 		 226 aa  267  8e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0439  putative secreted protein  57.55 
 
 		 226 aa  265  5e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0863  hypothetical protein  60.68 
 
 		 222 aa  256  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36240  hypothetical protein  57.41 
 
 		 218 aa  256  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0656  hypothetical protein  57.28 
 
 		 219 aa  236  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3709  hypothetical protein  53.88 
 
 		 217 aa  229  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4173  hypothetical protein  51.2 
 
 		 223 aa  218  5e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0333  hypothetical protein  49.77 
 
 		 223 aa  218  7e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.14489 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4511  hypothetical protein  52.68 
 
 		 219 aa  217  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1760  hypothetical protein  47.17 
 
 		 212 aa  217  1e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59900  hypothetical protein  52.68 
 
 		 219 aa  217  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.101829  hitchhiker  0.00000000000141059 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4090  hypothetical protein  49.54 
 
 		 223 aa  216  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0644  hypothetical protein  47.74 
 
 		 225 aa  179  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2759  hypothetical protein  48.89 
 
 		 246 aa  169  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0281915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3930  hypothetical protein  42.18 
 
 		 221 aa  145  6e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2388  hypothetical protein  28.29 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1026  hypothetical protein  25.98 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1064  hypothetical protein  25.98 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>