35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4175 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4175  putative secreted protein  100 
 
 
230 aa  471  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.774266 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1168  putative secreted protein  94.35 
 
 
230 aa  454  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1402  putative secreted protein  92.17 
 
 
230 aa  448  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.147645  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1260  putative secreted protein  92.17 
 
 
230 aa  448  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1188  hypothetical protein  92.17 
 
 
230 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.708151  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2349  hypothetical protein  91.74 
 
 
230 aa  444  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000252441  unclonable  0.000000139231 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3420  hypothetical protein  90.71 
 
 
229 aa  429  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.827841  normal  0.178813 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1630  putative secreted protein  82.06 
 
 
226 aa  394  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0439  putative secreted protein  80.72 
 
 
226 aa  382  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2855  hypothetical protein  83.09 
 
 
222 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0816055  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2190  hypothetical protein  77.03 
 
 
230 aa  361  5.0000000000000005e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2390  hypothetical protein  77.51 
 
 
230 aa  361  7.0000000000000005e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.385374  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0952  hypothetical protein  77.03 
 
 
230 aa  360  1e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0679  hypothetical protein  70.87 
 
 
230 aa  351  5e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276335  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0506  hypothetical protein  73.3 
 
 
233 aa  324  8.000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3019  hypothetical protein  60.38 
 
 
213 aa  274  7e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36240  hypothetical protein  57.67 
 
 
218 aa  271  5.000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2944  hypothetical protein  57.42 
 
 
213 aa  270  9e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1446  hypothetical protein  56.62 
 
 
222 aa  270  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3326  hypothetical protein  56.46 
 
 
213 aa  268  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.726467  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0863  hypothetical protein  56.94 
 
 
222 aa  258  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3709  hypothetical protein  55.29 
 
 
217 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0656  hypothetical protein  55.29 
 
 
219 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59900  hypothetical protein  53.21 
 
 
219 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.101829  hitchhiker  0.00000000000141059 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0333  hypothetical protein  53.92 
 
 
223 aa  237  9e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.14489 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4511  hypothetical protein  53.21 
 
 
219 aa  237  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4090  hypothetical protein  53.46 
 
 
223 aa  236  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4173  hypothetical protein  54.59 
 
 
223 aa  236  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1760  hypothetical protein  46.19 
 
 
212 aa  213  9.999999999999999e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0644  hypothetical protein  41.55 
 
 
225 aa  174  8e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2759  hypothetical protein  35.27 
 
 
246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0281915  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3930  hypothetical protein  38.46 
 
 
221 aa  134  9e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2388  hypothetical protein  25.52 
 
 
220 aa  56.2  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1026  hypothetical protein  21.7 
 
 
218 aa  53.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1064  hypothetical protein  21.7 
 
 
218 aa  53.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>