35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3420 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3420  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  469  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.827841  normal  0.178813 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1168  putative secreted protein  93.36 
 
 		 230 aa  436  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1188  hypothetical protein  92.48 
 
 		 230 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.708151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1402  putative secreted protein  92.04 
 
 		 230 aa  431  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.147645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1260  putative secreted protein  92.04 
 
 		 230 aa  431  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4175  putative secreted protein  90.71 
 
 		 230 aa  429  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.774266 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2349  hypothetical protein  91.59 
 
 		 230 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000252441  unclonable  0.000000139231 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1630  putative secreted protein  82.97 
 
 		 226 aa  400  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0439  putative secreted protein  82.1 
 
 		 226 aa  389  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2855  hypothetical protein  86.89 
 
 		 222 aa  381  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0816055  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2190  hypothetical protein  76.29 
 
 		 230 aa  374  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2390  hypothetical protein  75.86 
 
 		 230 aa  371  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.385374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0952  hypothetical protein  76.29 
 
 		 230 aa  373  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0679  hypothetical protein  72.53 
 
 		 230 aa  355  2.9999999999999997e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0506  hypothetical protein  74.27 
 
 		 233 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36240  hypothetical protein  59.07 
 
 		 218 aa  282  4.0000000000000003e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1446  hypothetical protein  58.45 
 
 		 222 aa  280  9e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3019  hypothetical protein  61.79 
 
 		 213 aa  280  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2944  hypothetical protein  60.29 
 
 		 213 aa  279  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3326  hypothetical protein  59.33 
 
 		 213 aa  276  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.726467  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0863  hypothetical protein  59.36 
 
 		 222 aa  270  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3709  hypothetical protein  57.28 
 
 		 217 aa  249  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0656  hypothetical protein  57.28 
 
 		 219 aa  246  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4173  hypothetical protein  56.52 
 
 		 223 aa  243  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0333  hypothetical protein  56.02 
 
 		 223 aa  243  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.14489 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59900  hypothetical protein  53.99 
 
 		 219 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.101829  hitchhiker  0.00000000000141059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4511  hypothetical protein  53.99 
 
 		 219 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4090  hypothetical protein  55.56 
 
 		 223 aa  241  6e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1760  hypothetical protein  48.34 
 
 		 212 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0644  hypothetical protein  42.54 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2759  hypothetical protein  36.96 
 
 		 246 aa  155  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0281915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3930  hypothetical protein  40.29 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1026  hypothetical protein  23.22 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1064  hypothetical protein  23.22 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2388  hypothetical protein  23.44 
 
 		 220 aa  53.1  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>