35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1760 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_1760  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  442  1e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2390  hypothetical protein  49.76 
 
 
230 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.385374  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0952  hypothetical protein  49.04 
 
 
230 aa  223  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2190  hypothetical protein  50 
 
 
230 aa  222  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2855  hypothetical protein  49.76 
 
 
222 aa  221  6e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0816055  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3420  hypothetical protein  48.34 
 
 
229 aa  220  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.827841  normal  0.178813 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1630  putative secreted protein  48.36 
 
 
226 aa  219  3e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3019  hypothetical protein  47.17 
 
 
213 aa  217  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2349  hypothetical protein  46.92 
 
 
230 aa  215  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000252441  unclonable  0.000000139231 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1168  putative secreted protein  46.45 
 
 
230 aa  214  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1188  hypothetical protein  45.97 
 
 
230 aa  214  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.708151  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4175  putative secreted protein  46.19 
 
 
230 aa  213  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.774266 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1260  putative secreted protein  46.45 
 
 
230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1402  putative secreted protein  46.45 
 
 
230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.147645  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1446  hypothetical protein  45.93 
 
 
222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0439  putative secreted protein  48.53 
 
 
226 aa  212  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0679  hypothetical protein  47.12 
 
 
230 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276335  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36240  hypothetical protein  50 
 
 
218 aa  212  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3326  hypothetical protein  45.67 
 
 
213 aa  208  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.726467  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0863  hypothetical protein  46.41 
 
 
222 aa  207  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2944  hypothetical protein  45.67 
 
 
213 aa  206  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3709  hypothetical protein  46.23 
 
 
217 aa  206  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0506  hypothetical protein  47.57 
 
 
233 aa  206  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0656  hypothetical protein  46.83 
 
 
219 aa  198  5e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4173  hypothetical protein  44.98 
 
 
223 aa  188  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0333  hypothetical protein  44.34 
 
 
223 aa  187  8e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.14489 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4090  hypothetical protein  43.89 
 
 
223 aa  187  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59900  hypothetical protein  45.5 
 
 
219 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.101829  hitchhiker  0.00000000000141059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4511  hypothetical protein  44.97 
 
 
219 aa  184  9e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2759  hypothetical protein  41.23 
 
 
246 aa  158  7e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0281915  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0644  hypothetical protein  41.23 
 
 
225 aa  155  6e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3930  hypothetical protein  34.29 
 
 
221 aa  137  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2388  hypothetical protein  23.62 
 
 
220 aa  58.9  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1026  hypothetical protein  23.65 
 
 
218 aa  52.8  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1064  hypothetical protein  23.65 
 
 
218 aa  52.8  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>