35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1188 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1188  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.708151  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1168  putative secreted protein  96.96 
 
 
230 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1402  putative secreted protein  95.65 
 
 
230 aa  456  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.147645  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1260  putative secreted protein  95.65 
 
 
230 aa  456  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2349  hypothetical protein  94.78 
 
 
230 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000252441  unclonable  0.000000139231 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4175  putative secreted protein  92.17 
 
 
230 aa  445  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.774266 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3420  hypothetical protein  92.48 
 
 
229 aa  432  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.827841  normal  0.178813 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1630  putative secreted protein  80.43 
 
 
226 aa  394  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0439  putative secreted protein  79.57 
 
 
226 aa  385  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2855  hypothetical protein  80.43 
 
 
222 aa  384  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0816055  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0952  hypothetical protein  78.47 
 
 
230 aa  363  1e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2190  hypothetical protein  77.99 
 
 
230 aa  362  2e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2390  hypothetical protein  77.99 
 
 
230 aa  361  6e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.385374  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0679  hypothetical protein  72.61 
 
 
230 aa  355  3.9999999999999996e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276335  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0506  hypothetical protein  69.96 
 
 
233 aa  325  3e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3019  hypothetical protein  61.79 
 
 
213 aa  278  5e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1446  hypothetical protein  60.68 
 
 
222 aa  277  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36240  hypothetical protein  59.8 
 
 
218 aa  275  4e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2944  hypothetical protein  58.37 
 
 
213 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3326  hypothetical protein  57.42 
 
 
213 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.726467  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0863  hypothetical protein  58.53 
 
 
222 aa  265  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3709  hypothetical protein  54.81 
 
 
217 aa  244  8e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0656  hypothetical protein  55.29 
 
 
219 aa  241  6e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4173  hypothetical protein  55.56 
 
 
223 aa  238  5e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0333  hypothetical protein  54.13 
 
 
223 aa  238  5e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.14489 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59900  hypothetical protein  53.55 
 
 
219 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.101829  hitchhiker  0.00000000000141059 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4090  hypothetical protein  53.92 
 
 
223 aa  236  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4511  hypothetical protein  53.55 
 
 
219 aa  237  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1760  hypothetical protein  45.97 
 
 
212 aa  214  9.999999999999999e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0644  hypothetical protein  43.64 
 
 
225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2759  hypothetical protein  36.09 
 
 
246 aa  152  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0281915  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3930  hypothetical protein  39.61 
 
 
221 aa  136  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2388  hypothetical protein  25.52 
 
 
220 aa  58.5  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1026  hypothetical protein  23.11 
 
 
218 aa  57  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1064  hypothetical protein  23.11 
 
 
218 aa  57  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>