35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_59900 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4511  hypothetical protein  99.54 
 
 
219 aa  457  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59900  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.101829  hitchhiker  0.00000000000141059 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36240  hypothetical protein  64.49 
 
 
218 aa  301  4.0000000000000003e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1446  hypothetical protein  59.53 
 
 
222 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0863  hypothetical protein  58.14 
 
 
222 aa  259  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2390  hypothetical protein  56.34 
 
 
230 aa  248  4e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.385374  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0952  hypothetical protein  56.34 
 
 
230 aa  248  4e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2190  hypothetical protein  56.34 
 
 
230 aa  248  5e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3420  hypothetical protein  53.99 
 
 
229 aa  243  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.827841  normal  0.178813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2349  hypothetical protein  53.99 
 
 
230 aa  242  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000252441  unclonable  0.000000139231 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0679  hypothetical protein  54.76 
 
 
230 aa  241  5e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276335  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2855  hypothetical protein  54.76 
 
 
222 aa  241  7.999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0816055  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1260  putative secreted protein  54.03 
 
 
230 aa  239  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1402  putative secreted protein  54.03 
 
 
230 aa  239  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.147645  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1188  hypothetical protein  53.55 
 
 
230 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.708151  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1168  putative secreted protein  53.21 
 
 
230 aa  238  5.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4175  putative secreted protein  53.21 
 
 
230 aa  238  5.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.774266 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1630  putative secreted protein  51.38 
 
 
226 aa  234  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0506  hypothetical protein  58.13 
 
 
233 aa  231  4.0000000000000004e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0439  putative secreted protein  50.23 
 
 
226 aa  223  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3326  hypothetical protein  52.2 
 
 
213 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.726467  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2944  hypothetical protein  52.2 
 
 
213 aa  221  7e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3019  hypothetical protein  52.68 
 
 
213 aa  217  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0656  hypothetical protein  47.91 
 
 
219 aa  204  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0333  hypothetical protein  46.85 
 
 
223 aa  202  5e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.14489 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4173  hypothetical protein  48.31 
 
 
223 aa  200  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4090  hypothetical protein  45.95 
 
 
223 aa  198  5e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3709  hypothetical protein  47.29 
 
 
217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1760  hypothetical protein  45.5 
 
 
212 aa  186  3e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0644  hypothetical protein  39.73 
 
 
225 aa  158  6e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2759  hypothetical protein  37.5 
 
 
246 aa  142  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0281915  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3930  hypothetical protein  39.44 
 
 
221 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2388  hypothetical protein  22.75 
 
 
220 aa  48.5  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1026  hypothetical protein  23 
 
 
218 aa  42.4  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1064  hypothetical protein  23 
 
 
218 aa  42.4  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>