39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3277 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3277  YfaZ family protein  100 
 
 		 180 aa  358  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2775  putative outer membrane protein  67.22 
 
 		 180 aa  258  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1319  hypothetical protein  67.22 
 
 		 180 aa  258  4e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2854  YfaZ family protein  67.22 
 
 		 180 aa  258  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2809  YfaZ family protein  53.89 
 
 		 180 aa  204  5e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2430  putative inner membrane protein  52.78 
 
 		 224 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2522  YfaZ superfamily  52.78 
 
 		 224 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.760699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2534  hypothetical protein  52.78 
 
 		 224 aa  202  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2479  hypothetical protein  52.78 
 
 		 224 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2638  putative inner membrane protein  52.22 
 
 		 224 aa  201  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3391  YfaZ protein  52.78 
 
 		 180 aa  181  6e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2545  outer membrane protein, YfaZ  52.22 
 
 		 180 aa  179  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1399  YfaZ family protein  52.22 
 
 		 180 aa  179  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.296552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2404  outer membrane protein, YfaZ  52.22 
 
 		 180 aa  179  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02135  hypothetical protein  52.22 
 
 		 180 aa  179  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457898  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02176  predicted outer membrane porin protein  52.22 
 
 		 180 aa  179  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.436146  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1408  YfaZ family protein  52.22 
 
 		 180 aa  179  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1117  YfaZ family protein  50 
 
 		 179 aa  174  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3198  YfaZ family protein  50 
 
 		 179 aa  173  9e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3009  YfaZ family protein  45.86 
 
 		 181 aa  151  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3392  YfaZ family protein  40.88 
 
 		 181 aa  137  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1050  YfaZ family protein  43.09 
 
 		 182 aa  137  7.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.354298  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0114  YfaZ precursor superfamily protein  36.72 
 
 		 149 aa  89.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0148  outer membrane protein  33.09 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1597  hypothetical protein  33.06 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261677  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0125  outer membrane protein  33.06 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2702  YfaZ family protein  28.18 
 
 		 179 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000258539  hitchhiker  0.0000794475 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2872  YfaZ family protein  28.18 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00022374  hitchhiker  0.00192784 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1303  YfaZ family protein  26.97 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2770  YfaZ family protein  27.62 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000254967  normal  0.114256 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1568  hypothetical protein  27.22 
 
 		 179 aa  51.2  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2740  YfaZ family protein  27.56 
 
 		 177 aa  51.2  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000342783  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1387  YfaZ family protein  26.4 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2972  YfaZ family protein  26.4 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.285706  normal  0.104145 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1410  YfaZ family protein  26.4 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.71685  normal  0.181504 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1371  YfaZ family protein  26.4 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376788  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3297  YfaZ family protein  25.54 
 
 		 179 aa  42.4  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.842985  decreased coverage  0.0000000230689 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3446  YfaZ family protein  26.17 
 
 		 179 aa  42.4  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.055004 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1170  cellulose synthase domain-containing protein  31.76 
 
 		 1271 aa  41.2  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.456707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>