26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1597 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1597  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  364  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261677  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0125  outer membrane protein  100 
 
 
150 aa  298  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0148  outer membrane protein  96.67 
 
 
163 aa  288  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0114  YfaZ precursor superfamily protein  84.55 
 
 
149 aa  204  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2854  YfaZ family protein  30.43 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1319  hypothetical protein  30.43 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2775  putative outer membrane protein  30.43 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3277  YfaZ family protein  33.06 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2809  YfaZ family protein  29.82 
 
 
180 aa  61.2  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1117  YfaZ family protein  30.91 
 
 
179 aa  61.2  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3198  YfaZ family protein  30.91 
 
 
179 aa  60.5  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2479  hypothetical protein  28.3 
 
 
224 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2534  hypothetical protein  28.3 
 
 
224 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2430  putative inner membrane protein  28.3 
 
 
224 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2638  putative inner membrane protein  28.3 
 
 
224 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2522  YfaZ superfamily  28.3 
 
 
224 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.760699  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3009  YfaZ family protein  28.7 
 
 
181 aa  57.8  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3392  YfaZ family protein  27.35 
 
 
181 aa  55.1  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1050  YfaZ family protein  29.41 
 
 
182 aa  52.8  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.354298  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1399  YfaZ family protein  30.34 
 
 
180 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.296552  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02135  hypothetical protein  30.34 
 
 
180 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457898  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3391  YfaZ protein  30.34 
 
 
180 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2404  outer membrane protein, YfaZ  30.34 
 
 
180 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02176  predicted outer membrane porin protein  30.34 
 
 
180 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.436146  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2545  outer membrane protein, YfaZ  30.34 
 
 
180 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1408  YfaZ family protein  30.34 
 
 
180 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>