33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2522 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2522  YfaZ superfamily  100 
 
 		 224 aa  454  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.760699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2638  putative inner membrane protein  98.66 
 
 		 224 aa  450  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2479  hypothetical protein  99.11 
 
 		 224 aa  451  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2430  putative inner membrane protein  98.66 
 
 		 224 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2534  hypothetical protein  97.77 
 
 		 224 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2809  YfaZ family protein  80.56 
 
 		 180 aa  304  6e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2545  outer membrane protein, YfaZ  86.11 
 
 		 180 aa  289  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2404  outer membrane protein, YfaZ  86.11 
 
 		 180 aa  289  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3391  YfaZ protein  86.11 
 
 		 180 aa  288  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02176  predicted outer membrane porin protein  85.56 
 
 		 180 aa  288  4e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.436146  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1399  YfaZ family protein  85.56 
 
 		 180 aa  288  4e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.296552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02135  hypothetical protein  85.56 
 
 		 180 aa  288  4e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457898  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1408  YfaZ family protein  85.56 
 
 		 180 aa  288  4e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2854  YfaZ family protein  50.56 
 
 		 180 aa  197  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2775  putative outer membrane protein  50.56 
 
 		 180 aa  197  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1319  hypothetical protein  50.56 
 
 		 180 aa  197  7e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3277  YfaZ family protein  52.78 
 
 		 180 aa  189  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1117  YfaZ family protein  47.22 
 
 		 179 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3198  YfaZ family protein  46.11 
 
 		 179 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3009  YfaZ family protein  42.54 
 
 		 181 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1050  YfaZ family protein  39.23 
 
 		 182 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.354298  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3392  YfaZ family protein  39.44 
 
 		 181 aa  132  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0114  YfaZ precursor superfamily protein  30.23 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0148  outer membrane protein  27.67 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1597  hypothetical protein  28.3 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261677  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0125  outer membrane protein  27.08 
 
 		 150 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2872  YfaZ family protein  26.86 
 
 		 179 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00022374  hitchhiker  0.00192784 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2702  YfaZ family protein  26.86 
 
 		 179 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000258539  hitchhiker  0.0000794475 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2740  YfaZ family protein  26.28 
 
 		 177 aa  45.4  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000342783  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3446  YfaZ family protein  28.03 
 
 		 179 aa  45.8  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.055004 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1303  YfaZ family protein  25.71 
 
 		 179 aa  45.1  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2770  YfaZ family protein  25.71 
 
 		 179 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000254967  normal  0.114256 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3297  YfaZ family protein  27.48 
 
 		 179 aa  42.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.842985  decreased coverage  0.0000000230689 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>