27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1050 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1050  YfaZ family protein  100 
 
 
182 aa  366  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.354298  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3009  YfaZ family protein  83.98 
 
 
181 aa  316  1e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3198  YfaZ family protein  64.09 
 
 
179 aa  228  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1117  YfaZ family protein  62.98 
 
 
179 aa  224  7e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2775  putative outer membrane protein  43.65 
 
 
180 aa  149  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1319  hypothetical protein  43.65 
 
 
180 aa  149  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2854  YfaZ family protein  43.65 
 
 
180 aa  149  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2809  YfaZ family protein  39.78 
 
 
180 aa  137  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2430  putative inner membrane protein  40.33 
 
 
224 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2534  hypothetical protein  40.33 
 
 
224 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2479  hypothetical protein  40.33 
 
 
224 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2638  putative inner membrane protein  39.78 
 
 
224 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2522  YfaZ superfamily  39.23 
 
 
224 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.760699  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1399  YfaZ family protein  40.88 
 
 
180 aa  131  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.296552  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02135  hypothetical protein  40.88 
 
 
180 aa  131  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457898  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02176  predicted outer membrane porin protein  40.88 
 
 
180 aa  131  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.436146  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1408  YfaZ family protein  40.88 
 
 
180 aa  131  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2404  outer membrane protein, YfaZ  40.88 
 
 
180 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2545  outer membrane protein, YfaZ  40.88 
 
 
180 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3391  YfaZ protein  40.88 
 
 
180 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3277  YfaZ family protein  43.09 
 
 
180 aa  122  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3392  YfaZ family protein  36.46 
 
 
181 aa  117  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0148  outer membrane protein  25.58 
 
 
163 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0125  outer membrane protein  29.41 
 
 
150 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0114  YfaZ precursor superfamily protein  25 
 
 
149 aa  52.4  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1597  hypothetical protein  29.41 
 
 
184 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261677  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3446  YfaZ family protein  32.58 
 
 
179 aa  40.8  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.055004 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>