36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3198 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3198  YfaZ family protein  100 
 
 
179 aa  357  6e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1117  YfaZ family protein  97.21 
 
 
179 aa  350  4e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3009  YfaZ family protein  68.51 
 
 
181 aa  246  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1050  YfaZ family protein  64.09 
 
 
182 aa  228  3e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.354298  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2854  YfaZ family protein  48.33 
 
 
180 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1319  hypothetical protein  48.33 
 
 
180 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2775  putative outer membrane protein  48.33 
 
 
180 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2430  putative inner membrane protein  46.67 
 
 
224 aa  165  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2534  hypothetical protein  46.67 
 
 
224 aa  165  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2479  hypothetical protein  46.67 
 
 
224 aa  165  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2638  putative inner membrane protein  46.11 
 
 
224 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2522  YfaZ superfamily  46.11 
 
 
224 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.760699  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2809  YfaZ family protein  44.44 
 
 
180 aa  163  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3277  YfaZ family protein  50 
 
 
180 aa  159  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1408  YfaZ family protein  45.56 
 
 
180 aa  147  8e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02176  predicted outer membrane porin protein  45.56 
 
 
180 aa  147  8e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.436146  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02135  hypothetical protein  45.56 
 
 
180 aa  147  8e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457898  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1399  YfaZ family protein  45.56 
 
 
180 aa  147  8e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.296552  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2545  outer membrane protein, YfaZ  45.56 
 
 
180 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2404  outer membrane protein, YfaZ  45.56 
 
 
180 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3391  YfaZ protein  45.56 
 
 
180 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3392  YfaZ family protein  36.56 
 
 
181 aa  108  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0114  YfaZ precursor superfamily protein  32.8 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0148  outer membrane protein  31.09 
 
 
163 aa  67  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1597  hypothetical protein  30.91 
 
 
184 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261677  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0125  outer membrane protein  31.68 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2702  YfaZ family protein  26.52 
 
 
179 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000258539  hitchhiker  0.0000794475 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1387  YfaZ family protein  26.52 
 
 
179 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1371  YfaZ family protein  26.52 
 
 
179 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376788  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2872  YfaZ family protein  26.52 
 
 
179 aa  48.5  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00022374  hitchhiker  0.00192784 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1303  YfaZ family protein  25.41 
 
 
179 aa  47.8  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2972  YfaZ family protein  25.97 
 
 
179 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.285706  normal  0.104145 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1410  YfaZ family protein  25.97 
 
 
179 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.71685  normal  0.181504 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2770  YfaZ family protein  25.97 
 
 
179 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000254967  normal  0.114256 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2740  YfaZ family protein  34.09 
 
 
177 aa  44.3  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000342783  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1568  hypothetical protein  25.97 
 
 
179 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>