29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1371 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1371  YfaZ family protein  100 
 
 
179 aa  367  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376788  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1387  YfaZ family protein  100 
 
 
179 aa  367  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1410  YfaZ family protein  99.44 
 
 
179 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.71685  normal  0.181504 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2972  YfaZ family protein  99.44 
 
 
179 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.285706  normal  0.104145 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2702  YfaZ family protein  92.74 
 
 
179 aa  345  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000258539  hitchhiker  0.0000794475 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1303  YfaZ family protein  91.06 
 
 
179 aa  342  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2872  YfaZ family protein  91.62 
 
 
179 aa  342  2e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00022374  hitchhiker  0.00192784 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2770  YfaZ family protein  90.5 
 
 
179 aa  339  1e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000254967  normal  0.114256 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1568  hypothetical protein  87.15 
 
 
179 aa  330  8e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3297  YfaZ family protein  55.88 
 
 
179 aa  218  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.842985  decreased coverage  0.0000000230689 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3446  YfaZ family protein  57.23 
 
 
179 aa  210  9e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.055004 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2962  YfaZ family protein  49.16 
 
 
179 aa  202  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2740  YfaZ family protein  53.46 
 
 
177 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000342783  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0027  YfaZ family protein  23.96 
 
 
191 aa  55.1  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2689  YfaZ family protein  29.07 
 
 
186 aa  53.9  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673529  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2505  YfaZ family protein  30 
 
 
189 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.634002  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0132  YfaZ  25.41 
 
 
197 aa  50.8  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00180457  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3198  YfaZ family protein  26.52 
 
 
179 aa  48.9  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2231  YfaZ family protein  25.65 
 
 
187 aa  48.5  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0687598  normal  0.632442 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2775  putative outer membrane protein  27.72 
 
 
180 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1319  hypothetical protein  27.72 
 
 
180 aa  47.8  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2854  YfaZ family protein  27.72 
 
 
180 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1117  YfaZ family protein  25.41 
 
 
179 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0581  hypothetical protein  24.61 
 
 
190 aa  43.9  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000000184382  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3392  YfaZ family protein  27.56 
 
 
181 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2334  YfaZ family protein  22.67 
 
 
190 aa  42  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.6281  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2479  hypothetical protein  26.29 
 
 
224 aa  40.8  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2534  hypothetical protein  26.29 
 
 
224 aa  40.8  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2430  putative inner membrane protein  26.29 
 
 
224 aa  40.8  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>