34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2534 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2534  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2430  putative inner membrane protein  99.11 
 
 		 224 aa  451  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2638  putative inner membrane protein  98.21 
 
 		 224 aa  447  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2479  hypothetical protein  98.66 
 
 		 224 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2522  YfaZ superfamily  97.77 
 
 		 224 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.760699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2809  YfaZ family protein  80.56 
 
 		 180 aa  303  1.0000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2545  outer membrane protein, YfaZ  86.67 
 
 		 180 aa  289  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3391  YfaZ protein  86.67 
 
 		 180 aa  289  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2404  outer membrane protein, YfaZ  86.67 
 
 		 180 aa  289  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02176  predicted outer membrane porin protein  86.11 
 
 		 180 aa  288  3e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.436146  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1399  YfaZ family protein  86.11 
 
 		 180 aa  288  3e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.296552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02135  hypothetical protein  86.11 
 
 		 180 aa  288  3e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457898  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1408  YfaZ family protein  86.11 
 
 		 180 aa  288  3e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2854  YfaZ family protein  50.56 
 
 		 180 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1319  hypothetical protein  50.56 
 
 		 180 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2775  putative outer membrane protein  50.56 
 
 		 180 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3277  YfaZ family protein  52.78 
 
 		 180 aa  188  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1117  YfaZ family protein  47.78 
 
 		 179 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3198  YfaZ family protein  46.67 
 
 		 179 aa  165  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3009  YfaZ family protein  43.09 
 
 		 181 aa  142  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1050  YfaZ family protein  40.33 
 
 		 182 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.354298  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3392  YfaZ family protein  38.89 
 
 		 181 aa  129  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0114  YfaZ precursor superfamily protein  30.23 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0148  outer membrane protein  27.67 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1597  hypothetical protein  28.3 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261677  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0125  outer membrane protein  27.08 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2872  YfaZ family protein  27.43 
 
 		 179 aa  49.3  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00022374  hitchhiker  0.00192784 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2702  YfaZ family protein  27.43 
 
 		 179 aa  48.9  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000258539  hitchhiker  0.0000794475 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3446  YfaZ family protein  28.66 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.055004 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2740  YfaZ family protein  26.92 
 
 		 177 aa  47.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000342783  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1303  YfaZ family protein  26.29 
 
 		 179 aa  46.2  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2770  YfaZ family protein  26.29 
 
 		 179 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000254967  normal  0.114256 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3297  YfaZ family protein  28.24 
 
 		 179 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.842985  decreased coverage  0.0000000230689 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1568  hypothetical protein  25.71 
 
 		 179 aa  42.4  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>